包皮过长会使大量的包皮垢结石存在于冠状沟，长时间会形成包皮炎，还可能排尿受到影响。包皮过长还容易形成小结石，造成导致并发症，阻碍阴茎发育，同时还会使泌尿生殖系统性传播疾病的发病率明显升高，最常见的是尿道炎，非淋性尿道炎，尖锐湿疣，严重还可能导致阴茎癌。
特别容易导致炎症感染反复发作，还能够造成龟头过度敏感，形成早泄，导致性功能障碍。反复发生的炎症感染和早泄，会影响精子的质量和性生活，容易造成不孕不育，所以包皮过长对生育是有影响的，应该尽早采取手术治疗。
有影响，假性包皮过长是指平时龟头不能完全外露，但在阴茎勃起后龟头则可以完全外露的一种包皮过长的情况，由于龟头过于敏感，容易让男性出现早泄等症状，有些人容易引起龟头炎等男性炎症。
当包皮过长时，过长的包皮包绕龟头，使龟头不能完全外露，包皮内板及龟头表面形成的分泌物不能及时清除，久而久之会形成包皮垢。如果个人卫生条件不好，不能每天清洗包皮内板及龟头表面过多的包皮垢，会诱发龟头包皮炎症，进而可引起阴茎癌的发生。另外，包皮过长，也是影响男性性生活质量的重要因素。
阴茎包皮炎症、阴茎头包皮粘连、阴茎包皮外伤、包皮口狭窄等都是导致包皮过长的原因，在生活中包皮过长的预防还要注意经常清洗生殖器，保持包皮和龟头内外的清洁干燥，另外，也要洁身自好，注意不要进行不清洁的性交。同时如果夫妇一方患性器官疾病要暂停性生活，及时治疗。