阴茎短小根本的原因是遗传基因的影响。另外包皮过长会阻碍阴茎的发育。后天性的阴茎短小，主要是因睾丸萎缩引起，青少年发育期间摄入的锌原素、雄性激素、维生素E和相关蛋白营养不足，缺乏后天能量补充，起不到壮大性器官的作用。
阴茎大小和个人体质遗传有关系，正常成人的阴茎在疲软状态下有7-9厘米，勃起以后大概就是11-16厘米。如果疲软状态下小于5厘米，而且勃起时小于10厘米，才能叫阴茎短小。作为大多数男性来讲，性成熟期是18周岁，基本发育就差不多了。
阴茎短小，先去医院抽血化验性腺系列。如果正常，最常见病因就是手淫和包皮过长，尽快彻底戒掉手淫，手淫导致发育期发育不良或者停止，阴茎海绵体挫伤，阴茎越来越短小，增加营养，多吃高蛋白食物，牛羊肉，海参，另外包皮过长、肥胖也是阴茎短小病因，如果有包皮过长割掉包皮，肥胖必须减肥，对发育期阴茎发育有好处。
可以多吃滋阴养肾补肾的东西，比如枸杞之类的，多补充一下蛋白质的，平时注意自己的饮食情况，多吃一些蔬菜和水果，更有效的方式是建议去正规医院进行手术治疗的。
这是可能的由于肥胖，导致皮下脂肪的很厚，这样阴茎的海绵体外露的部分就会相对的短一点的，还有救是肥胖脂肪就多，过多的脂肪就会造成雌激素的增高，这样就会导致雄激素的不足，是会影响阴茎的发育的。
性生活时间只要不低于二分钟就是正常的，阴茎短小没有什么药物可以治疗。阴茎大小存在个体差异。勃起后长8-16cm，自然状态下长3-5cm，如果勃起小于8厘米，疲软小于3厘米就属于阴茎短小。18周岁生殖器就发育成熟了。如不满意，阴茎延长术是实现成年人阴茎延长的方法，只有手术来治疗。
