治疗灰指甲需要系统治疗，因为此病会导致传染，一旦确诊需要注意卫生，切断传染源，用过的物品必须严密消毒，需要通过中西药结合的方法，配合刮甲以及封包的方法，一般需要坚持半年左右才可以。
一般情况下，灰指甲拔甲后不能根除，具体内容如下：
在治疗灰指甲时，将指甲拔掉，可以让药物直接进入病变部位，起到一定的效果。目前不需要拔甲，可以用小刀、指甲锉将病甲慢慢去除，也可以用药物封包，让指甲软化，然后脱落。直接拔掉指甲会很疼，会导致伤口变得更严重，还会引起其他的细菌感染。只拔甲并不能完全根治灰指甲，建议患者先把指甲去掉，然后用环吡酮、阿莫罗芬、碘酊进行消毒。
一般情况下，脚上有灰指甲可以采取服用药物、外用药物等方式根除。
1.服用药物：患者需要在医生的指导下使用药物进行治疗，如服用伊曲康唑胶囊或特比萘芬片，有利于缓解相关症状促进身体恢复。
2.外用药物：患者可以在医生的指导下使用药物进行治疗，如外用阿莫罗芬擦剂、特比萘芬软膏、咪康唑软膏、联苯苄唑软膏等，有利于控制病情。
一般情况下，灰指甲初期可以通过抗真菌治疗的方式加以根除。具体内容如下：
灰指甲的初期和晚期治疗方法是一样的，一旦指甲和甲床被真菌侵入感染，外用抗真菌药物效果有限，如果不及时治疗，病情会进一步恶化。可以选择口服抗真菌药物，比如第三代抗真菌药物，比如特比萘芬片或者伊曲康唑，连续服用三个疗程，服用前要检查肝肾功能是否正常，不需要外用药物。足部卫生要注意，鞋子要暴晒，环境要干燥。
灰指甲是霉菌感染引起的，是因为缺乏卫生，再加上受伤引起的。可以用抗霉菌类的药物治疗。对于顽固性的霉菌感染，可以把患病的指甲拔掉，然后用药治疗，注意不要吃辛辣的食物以免引发感染。
灰指甲需要积极使用抗真菌药物治疗，同时生活中需要注意，多吃清淡的食物，多用热水洗脚，要把水擦干净，要经常通风换气，减少细菌的滋生，还要穿透气性好的袜子和鞋子，要经常修剪指甲，避免指甲里面滋生细菌，到医院就诊，通过正规渠道治疗。