怀孕初期肚子疼腰疼，有可能是正常情况，也有可能是异常妊娠或其他疾病导致。
1.正常情况:在怀孕的初期，受精卵着床可能会导致子宫收缩，引起肚子疼腰疼。另外胚胎生长发育也有可能会出现这种情况，属于正常情况。
2.异常妊娠。在怀孕初期，如果发生先兆流产，宫外孕等异常妊娠，均有可能会因为子宫收缩而发生肚子疼腰疼，需要去医院做B超和血HCG化验来诊断。
3.其他疾病：如果发生肠炎、泌尿系感染、结石等疾病，也会出现腰疼和肚子疼的情况。
在怀孕初期的时候有见红肚子疼的症状，有可能是流产前兆，如果你怀孕已经超过40天了，建议可以到医院抽血化验一下人绒毛膜促性腺激素，加上孕酮，再做子宫彩超检查，排除宫外孕的可能。
不排除有先兆流产的可能，如果有见红的现象，一定要及时到医院进行检查，根据检查结果在医生的指导下对症治疗。同时一定要注意休息，不要过度劳累，不要剧烈运动。怀孕后会分泌黄体荷尔蒙，可以有效的保护胎儿、防止流产，有麻醉的作用，可刺激肠道而出现便意。
怀孕早期肚子疼腰疼可能是宫外孕或流产。
如果孕早期有比较严重的肚子疼痛、腰痛需要尽快去医院检查，是否是宫外孕导致的。如果不是，可能是孕酮低导致有流产前兆，需要中西药结合保胎治疗，如滋肾育胎丸，既补肾又安胎，能治疗孕期腰痛症状。
建议孕妇在日常生活中吃含有蛋白质的食物，多吃新鲜的蔬菜水果，饮食清淡，禁烟禁酒，注重休息，保持愉悦心情。远离刺激性气味，室内要定期开窗保证空气流通，定期产检。
怀孕两个月腰疼、肚子疼可考虑是否出现了先兆流产的情况。
妊娠2个月后腰部疼痛腹部疼痛，首先要注意阴道有没有红色，可能是因为有预兆的流产，或者是由于子宫收缩引起的，需要做B超，观察孕囊的生长状况，如果孕囊发育的很好，可在医生指导下使用黄体酮胶囊保胎灵，并在床上静养，一般10多天后再来做保胎治疗。B超显示孕囊发育不良，可以停止保胎，并建议停止妊娠。
孕妇在怀孕初期会出现腰痛、肚子疼的情况，主要是因为怀孕初期不习惯，或者是精神紧张，或者是盆腔充血、子宫变大，或者是相邻的组织受到了刺激。
一般来说，休息后通常是可以减轻的。如果有明显的疼痛或异常的出血，需要考虑是否存在妊娠后的先兆流产和宫外孕。需要到医院检查，确诊后再进行治疗。孕期注意饮食健康，规律作息。