怀孕六周有褐色分泌物可能是多种原因导致的，具体分析如下：
怀孕6周出现阴道棕色的分泌物，很有可能是由于子宫内有少量的出血，但是出血量很小，无法形成血流，因此会随着白带和其它的分泌物从阴道中排出。怀孕头三个月是容易发生流产的季节，出现阴道出血或血性白带是流产的主要特点，如果在怀孕期间出现阴道有不明的异常分泌物，要及时就医。
怀孕有褐色分泌物是胎儿着床所致，一般不要紧，如果是先兆流产，通常要紧，具体原因是：
妊娠期间有棕色分泌物是不是很严重的，要根据具体的情况来判断。妊娠初期如果有棕色分泌物，说明胎儿着床时有少量出血，如果出血量不大，不会有腹痛的表现。怀孕初期出现棕色分泌物也有可能是先兆流产，如果有大量的阴道流血、腹痛等症状，建议立即去医院做保胎处理。
妊娠8个星期出现棕色的分泌物，要怀疑是先兆流产，要做好子宫内的子宫彩超，看一下胎儿在子宫里的生长状况，然后再做进一步的检查。
如果B超显示胚胎的生长状况很好，就需要进行保胎处理，同时还要定期做血孕酮的变化，定期做B超，以确定胚胎是否已经不再生长，需要进行药物流产，在药物流产之前要做进一步的化验，避免出现凝血功能的问题，需要住院。
怀孕16周有褐色分泌物宝宝可能会有危险的。
怀孕16周，孕妇出现了褐色分泌物，首先需要考虑是流产前兆。孕妇需要尽快去医院做彩超检查，明确胎儿的发育情况，并在医生的指导下使用保胎的药物保胎治疗，另外，在治疗期间需要多卧床休息，养成良好的生活习惯，并密切观察出血情况，在褐色分泌物消失之后，再到医院进行复查。
妊娠5周时出现褐色分泌物可能是宫腔内出血异常引起的。
引起妊娠早期宫腔内出血异常的病因，大多考虑为妊娠后内分泌功能紊乱，使机体孕激素含量不足，或染色体异常引起胚胎发育异常，病毒感染，性生活刺激，剧烈运动，烟酒刺激引起胚胎发育异常。除此之外，还可因宫颈糜烂、宫颈息肉、子宫内膜炎而导致出血不正常。建议患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。
妊娠16周有棕色的分泌物，有可能是有先兆流产引起的。建议尽快到正规的医疗机构就医，先进行骨盆彩超，然后进行尿液检测，只有当膀胱充满了，才能确定是否存在胎儿的胎盘低置。彩超显示胎儿还活着，需要进行保胎，在此过程中要多注意多休息，避免进行剧烈运动。彩超显示胎儿没有胎心，说明胎儿已经不能正常生长，可以进行药物流产或者手术终止妊娠。