药流三天后孕囊还没完全排出需要去医院清宫治疗，以免出血过多。流产后要注意休息，不要吃辛辣刺激的食物，不要过度活动，注意外阴卫生，尽早去医院做清宫术，术后在医生指导下进行药物治疗。
药流孕囊没有排出，可能会出现出血量较少、早孕反应等症状。
药流孕囊没有排出，所以患者出血量较小，并且还会持续出现恶心、呕吐、食欲不振、厌油腻、腹痛等早孕反应，情绪波动也较大，表情淡漠或急躁易怒，建议患者立即就医。否则如果孕囊在宫腔内停留时间过长，可能会引发宫腔感染，出现发热、腹痛等症状，对患者身体伤害较大。如果确定孕囊未排除，建议患者行清宫治疗，并于两周后复查妇科彩超，观察子宫的恢复情况。
通常情况下，药流1-2小时后排出孕囊。具体情况分析如下：
根据个人的身体状况，排出孕囊的时间也不一样，一些体质敏感的人，在吃了米非司酮后，会出现孕囊排出的情况。但是大多数人在服用米索前列醇后1-2个小时内就会排出孕囊。如果超过两个小时还没有排除，那就是孕妇对这类药物的反应不是很灵敏，可以在一个下午的时间里继续进行爬楼梯，快走等运动促进孕囊排出。如果上述方法仍不能排除，建议做清宫手术。
药流见红后6-8小时左右时间就可以排出孕囊，由于用药情况不同，孕妇体质不同，所以说具体什么时候会排出孕囊就不能一概而论，只要在12小时内排出孕囊就好，可以在药流后及时采用B超复查，好了解宫内是否还有残留物，要是有残留物就要及时服用药物治疗，或者采用清宫手术治疗。
一般孕囊应在最后一次流产后3天内排出。在服用最后一次流产药物后的6-8小时内，可能会排出体外。如果长时间没有出血或没有孕囊，这很可能是失败了。因此，也有可能尽快安排彩色多普勒超声检查是否有腹痛。如有必要，可以选择刮宫手术。不要吃生食或冷食。
一般情况下，药流第二天不会排出孕囊，具体分析如下：
药物堕胎都是用米非司酮软化子宫，随后应用米索前列醇，引起子宫收缩，从而将子宫内的卵泡排出。米非司酮治疗后头两日服用，不会有任何症状，少数病人会有少量的阴道出血，不过不会排出孕囊，一般是在第3天就会排出。
平时女性要注意充分的休息，重视腹部保暖，多喝温开水，饮食以清淡、营养为主，不要熬夜，有助于身体健康。