囊肿体积不是特别大，如果是纯囊性的肿物，壁薄，透声好，那么可以先观察看看，三个月后复查，如果出现持续性加重的腹痛及时就诊。如果是囊实性的肿物或者是说复查囊肿明显增大，那么是手术治疗的。
若肿块持续存在或者增大，则可考虑手术治疗。手术方式的选择需要根据病人年龄、生育要求及对侧卵巢的情况决定具体手术范围，年轻女性会尽量予以行卵巢肿瘤剔除术，保留正常卵巢组织。目前多数的卵巢良性肿瘤均可通过腹腔镜手术治疗，手术技术非常成熟。
卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
卵巢囊肿轻度症状是中等大以下的腹内包块，如无并发症或恶变，其最大特点为可动性，往往能自盆腔推移至腹腔。恶性或炎症情况，肿物活动受限，有压痛，甚至出现腹膜刺激症状、腹水等。
卵巢囊肿多数是由妇科炎症引起的，先吃一些抗炎药物等月经干净，三天之后需要复查彩超，看是否有减小的趋势，囊肿大小不超过五厘米，如果有效果当然更好，如果观察超过五厘米，可以考虑手术治疗。
