在临床上要给予手术治疗，可以做开腹手术，也可以做腹腔镜手术。腹腔镜的手术损伤小，恢复会快一些，但是价钱也会贵一些。术中绝大部分会采取囊肿剔除手术的方式，保留卵巢组织，并且建议将剔除的囊肿送病理化验，根据病理结果临床再决定下一步的治疗方案。
如果在怀孕之前或之后没有发现卵巢囊肿，则左侧卵巢囊肿在怀孕三个月后出现。这可能是由于怀孕期间体内的激素水平。目前，卵巢囊肿的大小应首先确定。如果囊肿非常小，不能治疗，可以进行定期检查。如果囊肿很大，就可能导致流产。有必要结合自己的临床诊断，看看是否需要继续妊娠。
一般情况下，卵巢囊肿患者可以通过医学检查、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
如果是直径在5cm以下的卵巢囊肿，同时检查CA125、CA19-9、CEA、AFP等指标是否在正常范围内，可以在月经结束后进行妇科彩超检查。如果是一个直径超过5cm的卵巢囊肿，同时还要做妇科彩超检查。卵巢囊肿外科治疗通常是对有需要或尚未绝经的妇女，应行腹腔镜下摘除或剖腹切除。如果是绝经期后的妇女，或者是因为有恶性肿瘤的原因，需要进行手术治疗。
多卵巢囊肿治疗方法有一般治疗；病人应该积极进行锻炼，减少高脂肪、高糖食物的摄取，降低体重。这样可以促使雄激素水平下降，对恢复排卵有利。药物治疗；药物治疗可以对抗雄激素的作用，促使卵巢排卵。一般服用3-6个月左右，经过激素所平检测正常后就可以停止服药。腹腔镜手术治疗；如果这两种方法效果都不好，就需要考虑腹腔镜手术治疗。在腹腔镜下，手术穿刺卵泡，使雄激素水平下降，从而达到治疗目的。
无症状的可以保守治疗，也可试用一些中医治疗方法，卵巢囊肿是卵巢肿瘤的一种，各种年龄均可患病，但以20—50岁的女性最为多见，多为良性肿瘤，极少数是恶性肿瘤。可以密切随访，即2－3个月检查一次。
