肛窦炎可以用一些消炎抗菌的药物治疗。如果药物治疗效果不好，也可以通过手术治疗。肛窦炎是指肛门直肠区域发生的炎症。性病变可能导致肛门周围发红、肿胀和瘙痒等症状。必要时，应该去医院检查并听从医嘱。在平时生活当中，应小心清洁下体。
出现了肛窦炎如果是比较轻点的就可以选择药物，主要抗生素类药物消除炎症药物，如果是较严重的肛窦炎就要选择手术治疗了。肛窦由于其特殊的解剖结构容易出现炎症问题，基本上细菌的比较多，严重的可导致肛周脓肿的出现。
肛窦炎也可以部分用一些痔疮软膏来治疗，起到一定的作用。当然，药物治疗前可以使用蒲公英坐浴进行辅助治疗，更多的是需要注意饮食，辛辣刺激的食物是不能吃的，多喝水，多吃新鲜蔬菜、水果和粗纤维食物，并有规律地生活，只有这样才能定期避免便秘。
患有肛窦炎的病人可以用温盐水坐浴治疗，然后在肛窦底部使用5~银酸溶液，也可以用少量橄榄油灌肠。也可以使用各种类型软膏剂，同时口服抗生素。急需手术。肛窦炎如果不及时治疗，很容易引起肛瘘。
肛瘘保守治疗需保持局部清洁，可用药物坐浴或温水坐浴的方法。若肛门外口未破，有憋胀感，可将其挑破，使脓流出，减轻疼痛。局部可外用药膏，肛瘘时间较长后若出现肛周湿疹，瘙痒引起的红疹，可通过清热解毒的中药坐浴或外涂药膏治疗。在此期间需注意饮食，避免饮酒及食用辛辣刺激性的食物。具体用药请结合临床，由医生面诊指导为准。平时应该注意自己的饮食习惯，避免出现便秘的情况，要保持大便通畅，尽可能的规律饮食。
肛窦炎的治疗最主要的是局部治疗。使用药粉坐浴。多吃含有纤维素多的食物，保持大便通畅。平时饮食要清淡，不要吃辛辣油腻的食物，不要喝酒，保持大便通畅，可以用益生菌类药物比较合适。
