药流三天后孕囊还没完全排出需要去医院清宫治疗，以免出血过多。流产后要注意休息，不要吃辛辣刺激的食物，不要过度活动，注意外阴卫生，尽早去医院做清宫术，术后在医生指导下进行药物治疗。
药流第3天一般在服药之后6个小时之内，绝大多数病人都会排出孕囊。但是也有人对药物不敏感，有可能在6个小时之内排不出孕囊，就需要再次加强服用一次药物。如果服用药物之后还是没有排出，流血不多，没有腹痛，就可以在第2天接着服药。如果发生阴道流血增多，量大于平时月经量的2倍，就要及时行清宫术治疗。
药流第三天吃药多走动可以，对胚胎尽快排出体外是有好处的。因为在服了药物之后会引起子宫平滑肌收缩，这样妊娠囊与子宫壁之间会发生剥离，所以会先出现阴道流血，然后随着宫颈内口的开大妊娠产物就会排出。由于有的人阴道相对比较紧，妊娠产物会滞留在阴道后穹隆部位，多走动会在重力的作用下通过活动使妊娠产物排出体外。
药流后，因为子宫和卵巢都需要一个恢复的过程，通常1-2周内会有少量不规则出血和腹痛的情况，这都是属于正常的现象。如果是痛得比较严重，那么就考虑是流产不全，需要去做一下检查。
药流第三天肚子特别疼可能是子宫收缩、宫腔感染等原因导致的。
由于药物的作用会引起子宫的收缩，促使子宫内的残留物，或者是少量的积血排出体外，子宫的收缩会出现小腹部的疼痛，这是属于药物的正常作用所引起的。可以适当的喝点红糖水，用热水袋热敷一下，或者用一些活血祛瘀的药物来缓解疼痛。一周左右，慢慢会完全缓解的，如果疼痛持续而不能缓解，要考虑药流后宫腔内组织的感染，及时去妇科门诊进行B超的复查。
如果B超确定是宫内孕的话，最后一次药吃完后2小时有阴道流血和腹痛，在4到8小时就可以排出了。如果服药后2小时还不痛要加药物，用药后严密观察，失败要及时手术终止妊娠。
