卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
少女卵巢囊肿很严重，卵巢囊肿的危害是比较大的，除了自身产生的影响外，还直接影响女性的生育功能。此外，卵巢囊肿还有恶变的可能，可威胁到生命安危。会导致女性容颜早衰、引发流产、难产、导致水肿，影响生活、发生癌变，威胁生命、致不孕，影响生育。
卵巢囊肿多数是由妇科炎症引起的，先吃一些抗炎药物等月经干净，三天之后需要复查彩超，看是否有减小的趋势，囊肿大小不超过五厘米，如果有效果当然更好，如果观察超过五厘米，可以考虑手术治疗。
卵巢囊肿是由炎症或巧克力囊肿引起的。卵巢囊肿是由炎症引起的，可以通过抗炎药物、中药和西药的联合治疗而完全治。治率很高。卵巢囊肿是巧克力囊肿，应通过手术治疗。然后每天热敷腹部。可以再次检查超声波，看看囊肿是否缩小。囊肿缩小，你必须考虑手术治疗。
卵巢囊肿是可以通过手术取出囊肿的。平时要多注意情绪的调节，保持心情舒畅，多休息，多吃些清淡的，少吃辛辣刺，激性过大的食物，多吃水果，多喝点热水。具体需要遵训医嘱。
