卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
卵巢囊肿是可以通过手术取出囊肿的。平时要多注意情绪的调节，保持心情舒畅，多休息，多吃些清淡的，少吃辛辣刺，激性过大的食物，多吃水果，多喝点热水。具体需要遵训医嘱。
5厘米的卵巢囊肿，不算是很大。
不过也有可能会发生一些并发症，比如扭转、破裂或者感染等。如果之前没有发现过这种情况，可以在月经干净以后再复查一下B超。如果消失了，说明这是生理性的黄体囊肿，不用治疗。如果囊肿经过彩超检查发现囊肿内有乳头状突起，并且伴有丰富的血流信号，此时行肿瘤标志物检查，发现肿瘤标志物明显升高，考虑囊肿可能有恶变的可能，这时需要行手术干预。
通常情况下，卵巢囊肿61mm的患者可以通过手术治疗、日常护理等方式进行治疗。具体情况分析如下：
1.手术治疗：卵巢囊肿是卵巢内或其表面形成的囊状结构，免疫力下降、感染、吸烟、电离辐射等因素都有可能会导致卵巢囊肿，患者可能会出现坠胀、下腹部不适、月经异常等症状，由于卵巢囊肿61mm的患者使用药物并不能得到较好的治疗效果，患者可以通过卵巢囊肿切除术、附件切除术、子宫切除术等方式进行治疗。
2.日常护理：患者配合医生进行治疗时，平时应注意个人卫生，保持私处的清洁、干燥，早睡早起，还可以适当的进行运动，促进身体恢复的同时，还能提高患者免疫力。
卵巢囊肿的化学治疗为卵巢囊肿的主要辅助疗法。估计手术切除肿瘤困难，术前先用1～2疗程化疗，可提高手术切除术。术后应用化疗则可预防复发，手术切除不彻底者，化疗后可获暂时缓解甚至长期存活，手术无法切除者，化疗可使卵巢囊肿缩小、松动，为再次手术创造条件。这是卵巢囊肿的治疗方法之一。
