药物治疗，对于诊断出卵巢内有混合性包块时，可据情况先保守治疗一到两个疗程，再次复查B超，如有缩小可不手术，若无改变或甚至有长大，就必须手术。还可以去找正规中医治疗。
卵巢囊肿一般会有月经改变、可动性、无触痛、中等大以下的腹内包块等症状。治疗主要以手术为主，平时囊肿不大可以药物进行调理。只要每年定期B超复查就行，如果囊肿会慢慢长大，是需要通过手术来处理，做手术把囊肿切除。
卵巢囊肿是有可能影响怀孕的，卵巢囊肿是卵巢肿瘤的一种，卵巢是卵子发育、成熟、排出的场所，当卵巢受到破坏时是会造成不育的，如果同时伴有进行性加重的痛经及性交痛、盆腔有触痛性结节，则应考虑子宫内膜异位症（即巧克力囊肿），采取不同的治疗。
多卵巢囊肿的出现会与饮食有一定的关系，由于不好的饮食结构和生活习惯不好，就会引起肾虚，肝肾同源，肾卵巢囊肿病理虚肝亦虚，进而引起下焦代谢循环变慢，造成卵巢疾病和内分泌失调，免疫功能下降，引发疾病出现。内分泌因素也会导致卵巢囊肿的出现，一般多发生在未产妇或未生育妇，妊娠对卵巢肿瘤似有对抗作用，认为每日排卵所致卵巢表层上皮细胞反复破损与卵巢囊肿的原因有关。
症状有，女性下腹部不舒服为病人未触及下腹肿块前的最初症状。如肿瘤没有并发症，极少疼痛。要是发生腹痛，尤其忽然发生者，多系瘤蒂发生扭转，偶或为囊肿破裂、出血或感染所致。月经紊乱；腹围增粗腹内肿物。
卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
