精子畸形率高不一定会导致胎儿畸形。具体分析如下：
精子畸形是指正常男性精子的头、体、尾部出现变异形态，通常是由精索静脉曲张、精子在附睾发育障碍、生殖道感染等因素导致的。该情况可能会降低精子的活性，从而影响受精功能，使精子、卵子的结合能力降低。但是胎儿畸形一般是指胎儿在子宫内发生的结构或染色体异常，也就是精子和卵子在进行受精之前存在遗传物质异常，在受精之后出现基因突变等现象。所以，精子畸形率高不一定会导致胎儿畸形。
精子畸形率高会影响怀孕。精子化验，正常形态的精子要占到4%左右。如果正常形态的精子小于1%，畸形的精子约99%，这种怀孕的可能性要明显的降低。一定要查清楚畸形精子到底有多少，如果不大于96%，则是一种正常的。因为精子是不断的产生、排出、成熟，只要一次射出的精子正常的占到3%-4%，则是正常范围，一般都可以正常怀孕，太高则容易导致怀孕的可能性明显降低。
精子畸形率越高，导致许多男性不育的可能性也越高，意味着受孕机率的降低，但与胎儿畸形并无明确相关性，畸形精子症并不一定会导致胎儿畸形。因为女性生殖道有优胜劣汰的功能，精子在穿过女性生殖道的过程中会将大部分畸形精子淘汰掉，从而排除了畸形精子和卵子结合的可能，最终保证受孕的精子的质量。
可以在医生的指导下，服用药物，具有一定的促精子发育的作用。如果效果不好，可以做精子的筛选。如果精子的畸形率过高，对怀孕的几率有一定的影响，即便是同房后怀孕，也容易出现胚胎发育不好情况的。
生活习惯不好、不洁性生活、长期服用药物、营养不良、经常高温蒸浴，会导致精子畸形率高。改善精子畸形需要明确病因，对症治疗。日常戒烟戒酒，无熬夜、无久坐。日常可以多吃黑豆、木耳类食物。
及早到正规医院详细的检查，明确病因后做针对性的治疗。精子畸形可造成男性不育症和妇女习惯性流产等。畸形精子如超过70%，应进行染色体检查，如有染色体病，则治疗困难。
