非常客观地说，结肠镜检查没有痛苦。只有看到结肠镜这么长，以至于它从肛门插入肠道。首先，有一种恐惧感。如果受到刺激，会感到过敏。只有在检查过程中，才会将二氧化碳气体注入肠腔，使肠道扩张，以便更好地观察。有时感觉有点腹胀，医生会在检查前尽可能释放气体。
一般就是酸胀顶的慌，自己放松不要紧张就好；就是在静脉麻醉下做肠镜，也就睡十几分钟醒来就没事了，一般没有什么副作用，建议不要担心。但是无痛肠镜需要提前预约，大夫需要说好多注意事项，做术前评估。
肠镜分有痛性的和无痛性的。有痛性就是普遍的肠镜检查。无痛性的检查项目相对来说费用比较高、而且需要打麻醉，这种肠镜只有轻微的不适感，没有任何疼痛。肠镜的检查时间需要根据熟练程度、病变的程度有无等因素密切相关，如果没有特殊情况都很快的。
肠镜检查是会有疼痛感觉的。与胃镜检查相比，由于结肠肝曲、脾曲等会有生理性的弯曲，因此肠镜检查更加复杂，难度更大，病人的不适反应也就更明显。而且在行肠镜检查的过程中，还需要不断注气，也会加重病人的疼痛、腹胀等症状。
肠镜的检查是很有必要做无痛的。可以通过结肠镜发现大肠部分的肠道是否存在异常，因为肠镜检查需要通过肛门，将镜子放进肠道，对胃肠道有一定的刺激性，部分病人会有明显的肠道不适或者疼痛感，导致检查不能顺利完成。所以一很有比较做无痛的。
