如果确定是咳嗽引起的头疼，要及时进行治疗，还有就是这些原因像支气管炎，大多是由于上呼吸道感染蔓延而来，发病较急，初期多为干咳，随之逐渐出现咳嗽、咳痰等不适，严重时因呼吸困难而出现缺氧，嘴唇变为青紫色。
流感后咳嗽、头疼患者，可选用连花清瘟胶囊等对症药物进行治疗，同时配合日常生活调理缓解症状。
流感是由流感病毒引起的急性呼吸道疾病。病毒侵犯呼吸道，在气道黏膜上增殖引发炎症反应，炎性物质刺激呼吸道黏膜，出现咳嗽症状。头疼则是由于炎性物质刺激头部血管所致，或因炎症反应引起发热，导致头部血管扩张，诱发头疼。
连花清瘟胶囊具有广谱抗病毒、抑菌抗炎、调节免疫的作用，可以抑制甲型流感病毒（H1N1、H3N2等）、乙型流感病毒等多种流感病毒复制，减轻机体炎症反应，研究证实可有效缓解咳嗽、头疼、发热、鼻塞流涕、咽痛、肌肉酸痛等不适。该药为纯中药制剂，安全性良好，服用后无嗜睡等不良反应。
另外，患者在治疗期间还应注意清淡饮食，不吃辛辣刺激性的食物，以免刺激呼吸道导致咳嗽加重。
宜给予轻宣凉燥，理肺化痰的治疗。口服消炎止咳的药物治疗，控制炎症以后才能彻底恢复正常。很多人常在激烈咳嗽、喷嚏后出现短暂、严重的头痛，避免咳嗽后头痛不再发生，称为咳嗽性头痛。
可能是呼吸道感染引起的头疼和咳嗽。在临床上如果是呼吸道受到细菌和病毒感染，并不一定会有流鼻涕现象，通常患者会出现头痛、咳嗽、咽喉肿胀疼痛等现象。使患者无法正常入睡，身体出现困乏等不适感。可以在医生指导下口服抗病毒等抗生素药物进行治疗，比如阿莫西林、头孢克肟等等，并配合止咳药物来改善。在治疗期间应多喝水，多吃新鲜的蔬菜和水果，万不可吃辛辣刺激的食物，以免导致症状加重。
咳嗽出现头痛多见于长期慢性咳嗽患者，也可见于剧咳患者，可有高血压，偏头痛等疾患病史，需要积极止咳治疗，必要时服用止痛药物，缓解头痛病症，注意保暖，避免冷空气刺激，戒烟。
可以考虑抗生素类药物，积极进行抗炎治疗。同时，一些清热解毒的中成药可作为辅助治疗，止咳药物可与对症治疗相结合。多喝温开水，多吃新鲜蔬菜，补充维生素C，避免摄入各种辛辣食物，需要避免吸烟和饮酒，多注意休息。
