相对而言，同卵双胞胎畸形发生率要高于单胎。
胎儿在子宫内需要母体提供的羊膜囊和胎盘。同卵双胞胎是由一个受精卵在子宫内着床，分裂成两个细胞而发育形成。双胞胎尤其是单绒毛膜性双胎，如果出现两个胎儿共用一个胎盘的情况，容易发生双胎输血综合征，导致胎儿生长受限。如果两个胎儿在一个羊膜囊内，则容易发生脐带交锁，导致胎儿死亡。单胎则是一个胎儿使用一个羊膜囊和胎盘，不会发生上述情况。
因此在确认胚胎为同卵双胞胎之后，孕妇应及早对双胞胎的人绒毛膜性进行检查，方便之后的孕检。孕妇可以在怀孕12至14周进行nt检查，15到20周进行唐氏综合征的筛查，20周以后进行大排畸检查，必要时可以做无创DNA检查。
双胞胎的胎儿有可能偏小。需要看胎儿的双顶径和股骨综合考虑体重，孕期定期去医院检查发育情况和孕妇的健康情况，看是否正常。孕后期不要做剧烈运动，适当休息，密切观察胎心和胎动的情况，胎动过频或是过慢，需要及时去医院检查就诊。
单绒双羊是双胞胎。
通常来说单绒双羊是指孕妇怀孕时有一个胎盘，一个绒毛膜囊和两个羊膜囊，两个胎儿的情况。一般单卵双胎容易出现单绒双羊的情况，怀单绒双胎的孕妈的风险会比怀单胎的孕妈的风险大，可能会出现双胎输血综合征，导致双胎的发育情况不一样，可能会出现一个胎儿发育比较大，而另外一个胎儿的发育比较缓慢，严重者营养不良或者时胚胎停育的情况。
生双胞胎并不是人为能够控制的，双胞胎有一定的遗传因素影响，如果说父母以及双方近缘亲属有生双胞胎的，生双胞胎的可能性比较大。如果家族史当中基本没有生双胞胎的，生双胞胎的可能性比较小。使用促排卵药物也能够增加双胞胎的几率。因为有时候促排卵药物能够促使2个到3个优势卵泡形成，可能会形成双胞胎，但是要密切监测，以免出现卵巢刺激症。
没有明显的母胎异常的双胞胎妊娠，可以选择于38周末终止妊娠。一旦出现胎盘功能减退，妊高症，胎儿宫内发育迟缓，胎心病理性改变的情况，要立刻终止妊娠。如果出现妊高症、严重的胎盘功能减退、或者2个宝宝体重相差大于20％，为保证母婴安全，应立即行剖宫产。
单绒双羊双胞胎是一个胎盘，一个绒毛膜囊和两个羊膜囊，两个胎儿：
受精卵分裂发生在受精之后的3-8天，单绒双羊双胞胎是指两个羊膜囊外分别包裹一层羊膜，羊膜外再包裹层绒毛膜，即一层绒毛膜，两层羊膜，相当于居室的一室两厅。单绒双羊双胞胎的胎盘共用，胎儿之间可能发生交通支，风险性较大。比如双胎输血综合征，指两个胎儿一大一小差别较明显，选择性的生长受限；