可以使用根尖挺或者较细的牙挺，向下使力，撬动牙根，当牙根有一定活动度的时候再使用拔除牙根的钳子将残留的牙根拔除干净。拔除牙根以后要对拔牙窝进行一定的刮治，将里面感染的肉芽组织完全刮除干净，避免后期出现其他的病变。
如果剩下的牙根正好位于牙龈下面，一般需要用器械一点点把牙根给翘出来，在拔的过程当中会使用麻药，所以也并不会出现明显的疼痛，长期不拔的牙根容易引起慢性根尖周炎并形成瘘管，对牙齿健康极为不利。拔牙根一颗价格大约是50元到200元，拔牙根的具体费用根据患牙病情的难易、轻松缓急的不同而不同。
拔烂牙根，首先要确定牙根是不是有炎症。正常下，拔牙不会痛，因为会给进行局部麻醉，局部麻醉分为组织麻醉和浸润麻醉。用上局部麻药以后不影响意识，能够感觉到在口内进行操作，有触感但没有痛觉。
拔烂牙需打麻药，如不打麻药，疼痛程度不能承受，拔烂牙根时确实会有些疼痛。目前由于麻药的进步，基本上不会出现拔牙期间疼痛的情况，如出现疼痛，可再追加麻药，一般可达到较好麻醉效果，即部分对麻药不敏感，如酗酒，可能对麻药产生耐药，此情况则会有疼痛。
只剩下牙根需要拔除时，到正规医院的口腔科进行牙齿的拔除术。因为正规的医院器械的消毒会有保障，拔除之前拍摄此牙的根尖片或者曲面断层片，看看牙根的形状，走行的方向，有几个牙根，是否有牙根的畸形，以及与重要的解剖结构，如上颌窦、下牙槽神经管的关系。确定以后一般先用麻醉药麻醉，然后分离牙龈，用牙挺将要拔除的牙根挺松，再用牙钳或者牙挺将牙根取出。
旦智齿根部留在里面，危害并不是很大，当创口长平时，剩下的根也都会再长出来，刚拔完创口，不能吃太烫的食物，拔除难度大的可以输头孢治疗，或者氯己定的漱口水消炎抑菌，也可以吃甲硝唑进行消肿。
