治疗的方法有修复腭裂手术的治疗基本原则是延长软腭，闭合腭咽，恢复正常吞咽和发音功能。还有原则治疗的方法，明显提高大龄患者的腭咽闭合率，对腭隐裂的患儿可严密监护，只有当出现喂养、听力或语音问题时才考虑进行腭裂的修复。
主要病因有：母亲怀孕早期感染流感病毒、风疹病毒；遗传因素；怀孕期间服用镇静药、抗癫痫药、激素类药或大量接受X线照射等。主要表现为出生后上唇和上颚裂开成两瓣或三瓣，唇裂手术时间为生后3个月。腭裂为生后18个月。
对于唇腭裂患者的最佳手术时间，原则上是越早治疗越好。唇裂手术在患者机体免疫力健全的情况下，最早可在出生后24小时内手术，也可在出生3个月后，因为这时不仅婴儿的免疫力较强，可以耐受感染，而且这时机体的组织细胞也都很幼稚，不易形成瘢痕，为术后畸形恢复，创造良好的条件。而腭裂手术最早也要在婴儿出生后6个月以后进行。
好是用母乳喂养。母乳含有来自母体的免疫抗体，能增加抵抗力。不会引起过敏。有唇腭裂婴儿的饮食方面不用担心，他自己的本能有办法吃奶喝水。只是要注意以下事项：母亲要保持愉快的心情。如果心情不好，就会影响到乳汁的质和量。喂乳前，要洗手，清洁乳房和乳头，做乳房按摩，使乳汁容易流出。坐在有靠背的椅子上。母子采取舒适的姿势。
可以多吃一些绿色蔬菜，有的也会出现伤口撕裂的问题出现，那么这时候就要及时的去医院进行修复，避免病情的恶化，可以多服用一些能够增加身体抵抗力的食物，多吃一些绿色的蔬菜。
治疗唇腭裂要进行手术治疗，唇腭的整形手术可能要分多次完成，寄希望于一次手术即可成功是不现实的。唇腭裂要初步诊断病患程度如何，尽快治疗、按照序列治疗的程序进行治疗。在唇腭裂手术时间方面,尽可能做到在2岁前完成腭裂修复术.对于裂隙较窄,手术后可不暴露或少暴露硬腭裸露骨面的患者,以一岁内完成唇腭裂整复手术为好.而对于裂隙严重,术后有可能遗留较大面积裸露骨面时,则可将手术时间适当延迟。