扁平苔藓可以通过电子显微镜和病理切片发现可疑的病毒和细菌，一般高黏血症与再生循环障碍与扁平苔藓有很大的关系，平时要注意保持愉悦的身心，不要有太大的压力，生活作息要规律，可考虑中西医结合治疗。
如果一些孤立性的皮肤损害，一般选择局部乳膏来进行治疗，如果皮损非常广泛的话，一旦停药之后，非常容易复发一般选择使用窄波紫外线或者是长波紫外线和光化学疗法来进行局部治疗。
轻微口腔扁平苔藓能自愈，但是自愈的病患很少，是因为口腔扁平苔藓病因及发病机制到现在尚不明确。要避免口腔接触任何刺激性食物，尤其要注意有医治效果的牙膏如果有刺激感，也不能用。
口腔部位有扁平苔藓是由于真菌性的感染导致的症状，需要及时对症的使用抗真菌的药物来治疗，平时需要注意口腔部位清洁卫生，饮食上注意调养，不要吃生冷辛辣刺激性的食物。
外阴患上了扁平苔藓是一种真菌感染引起的，可以服用药物治疗，因为真菌感染后想根除是比较慢的过程，配合药物治疗才好，同时用药期间不能过性生活，如果有脚气可以一同治疗为好的，男性也要同时配合治疗的。
如果局部症状比较明显就需要在进行药物治疗，可以局部用药，也可以全身用药。另外全身用药主要是应用免疫类药物，虽然扁平苔藓的病因并不明确，但免疫因素还是有很大的原因，所以对于口腔扁平苔藓应该尽早来治疗。