最主要就是使用抗病毒的药物，比如更昔洛韦或者使用抗病毒的免疫球蛋白制剂以及干扰素转移因子等。丙氧鸟苷有防止巨细胞病毒扩散的作用，如果与高滴度的抗巨细胞病毒免疫球蛋白合用，可以降低骨髓移植的巨细胞病毒肺炎并发症死亡率。
宝宝巨细胞病毒感染有必要进行抗病毒治疗。
病人经常会有突发剧烈头痛、恶心呕吐、伴头晕或猝倒，可能在紧张刺激下加剧，还会产生耳鸣。今后要注意小孩的卫生和安全，避免孩子再因卫生问题而患上其他疾病，出现黄疸或者是肝炎症状时就会被医生诊断为病毒性肝炎，这是非常危险的，也是最容易发生并发症的。此外，由于治这种病的药也会损害肝脏，因此，才有必要进行肝功能检测。并非病毒对肝功能造成了伤害，但由于药物副作用，要是被这种病毒感染了的话，用药物治疗，也会有造成肝损伤的情况，同时还需监测肝功能。
新生儿巨细胞病毒感染可以治好。由于大多数新生儿巨细胞在孩子有症状以后才能诊断出来，新生儿巨细胞病毒感染常常会出现并发症，比如出现早产、低出生体重以及黄疸、肝脾肿大，甚至会引起孩子智力低下、血小板减少等。
不能自愈的。巨细胞病毒感染症是由巨细胞病毒（CMV）引起的先天性或后天性感染。感染巨细胞病毒后的临床表现和转归与个体的免疫功能状态密切相关。免疫功能正常者因密切接触感染者的分泌物而感染。积极抗病毒治疗，防止各种并发症的发生。
巨细胞病毒感染引起肝损伤可以治好的。在饮食上一定要有高蛋白，低脂肪，高维生素的食物摄入，不能吃油腻性食物，油炸性食物和高胆固醇类的食物，一定要少油少盐少糖，少脂肪摄入，多吃高维生素的食物，有助于肝细胞的修复。
巨细胞病毒感染，可应用各种抗病毒制剂如GCV、抗巨细胞病毒的免疫球蛋白制剂、干扰素及转移因子等来治疗，在治疗之后也要注意预防。平时也要注意有意识的身体素质的锻炼，提高机体免疫力，预防病毒感染，要注意卫生环境，饮食环境，饮食方面建议以清淡营养为主。