一般来说，脑干损伤可通过药物治疗、日常调理的方式进行处理，具体分析如下：
针对出血引起的脑干损伤，建议通过手术的方式进行治疗；也可以用甘露醇进行脱水治疗，缓解症状；针对外伤或炎症引起的脑干损伤，可以在医生的指导下应用单唾液酸四己糖，神经节苷脂等药物，配合抗生素，糖皮质激素进行治疗。在日常生活中，患者要注意饮食健康，戒烟戒酒，以清淡和易消化的食物为主，忌辛辣刺激的食物，多吃新鲜的水果和蔬菜，少食多餐，不要暴饮暴食，保持心情舒畅，适当运动，比如慢跑、游泳等，有利于身体健康。
胞二磷胆碱在临床上是用于急性颅脑外伤，或者是与治疗颅脑手术后，出现了意识障碍，可以促进脑血管疾病偏瘫肢体的运动功能恢复。这种药物是属于核苷的衍生物，可以促进大脑功能的恢复，同时可以促进苏醒。有脑保护的作用。
如果是脑干损伤导致的，严重的昏迷不醒，那么病情是特别严重的，绝大部分病人都是难以生存下来，要在当地的三级甲等公立医院神经外科，住院治疗，病情稳定以后，尽快做高压氧康复针灸康复和物理康复治疗。
胞二磷胆碱可以通过降低脑组织中谷氨酸浓度，减少神经性神经递质引起的细胞死亡。同时，胞二磷胆碱还能通过提高大脑皮质和新纹状体中的ATP浓度，起到神经元保护作用。胞二磷胆碱注射液可以改善缺血造成的空间定位和记忆力缺陷，其主要机制为增加海马乙酰胆碱酯酶ATP酶的活性和改善胆碱能神经传递，起到改善记忆和认知功能的作用。
主要作用就是可以用于改善脑代谢，降低脑血管阻力，改善脑循环。治疗脑外伤或者是脑血管疾病引起的一些偏瘫，偏身感觉减退，语言功能障碍。对于促进大脑功能的恢复，促进昏迷的病人觉醒，有很好的治疗作用，但是需要注意在脑内出血的急性期，不宜大量应用。
胞二磷胆碱胶囊，用于治疗颅脑损伤和脑血管意外所引起的神经系统的后遗症，并可用于帕金森氏综合症的治疗。血压下降、胸闷、呼吸困难等症状，应立即停药并采取适当的处理。
