需要对扁桃体肥大进行治疗，治疗扁桃体炎的同时，也要补充钙剂，还要坚持给予一段时间的增强身体免疫能力的药物或者保健品，平时要加强营养，合理膳食，多晒太阳，孩侧着身子睡觉，防止呼吸窒息。
两岁宝宝扁桃体肥大因为宝宝太小一般可以使用一些抗感染的药物以及外用喷的激素，缓解炎症水肿症状，从而改善上呼吸道的症状。关键在于平常要注意防寒保暖，饮食要清淡，不要吃辛辣刺激的食物，追休息，多喝水。
咽部反复疼痛或反复发烧，如果一年四五次以上可以考虑行扁桃体切除术。这时要明确是不是扁桃体发炎引起的，有时咽痛不是扁桃体发炎所引起，而是其它的原因，切了扁桃体解决不了问题。还有些只是反复咳嗽的孩子多不是扁桃体引起的，不需要切除扁桃体。
如果是病毒感染引起的扁桃体肥大，口服消炎药物，如果是化脓性扁桃体炎，一般都是细菌感染引起的，首选青霉素类的药物，如果同时伴有发烧，咽痛等症状，也可以用冰块冷敷颈部或者是用冷毛巾冷敷，也可以起到收缩血管，消炎止痛的作用。
幼儿扁桃体肥大可以通过局部的一个营养调理治疗控制改善，也就是说通过消炎的药物去进行控制调理，是临床上相对来说帮助比较大的，或者幼儿扁桃体肥大可以直接手术摘除，根据幼儿的情况选择治疗的方法。
扁桃体是一个淋巴免疫组织，主要在口咽两侧，腭咽弓和腭舌弓之间。儿童扁桃体肥大的治疗分保守治疗和手术治疗两种。保守治疗是通过免疫调节剂和中成药调节免疫功能。
