阴茎发育不良怎么治疗最好，需要视情况而定。如果是在青少年时期、未成年之前出现阴茎发育不良，一般可以通过外源性地补充雄性激素，促进男性阴茎的发育，可以肌肉注射绒毛膜促性腺激素，或者口服安特尔。如果是成年人，一般可以使用药物治疗或者其他的方式一般效果都不好。建议可以采用手术的方式，最常见的就是阴茎延长手术，或者通过阴茎海绵体假体植入手术。
一般情况下，大脑的发展可能会造成儿童的智商下降，严重的还会造成肢体动作和言语能力下降。在所有的智力缺陷患儿中，大约四分之一的智力是正常的，大约1/2的智力是轻度和中度的，1/4的是中度智力的。对于轻微的脑发展不良，可以通过饮食和药品结合进行调理，平时可以多食用一些益气活血、健髓益智的食品，比如核桃仁、牡蛎、深海鱼等。在药物方面可以选择一些药物，比如维生素E、甲钴胺等，可以促进大脑血液循环，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。
通常情况下，脑发育不良可以进行健脑补肾治疗，一般可以可以给儿童使用安神补脑液、补肾地黄丸，都可以良好的帮助大脑发育。其次还可以给儿童使用优甲乐来治疗，因为脑发育不良可能是甲状腺分泌不足导致的。
另外，还可以艾灸儿童的足三里穴、肾腧穴；艾灸足三里穴一般可以起到健脾作用，而艾灸肾腧穴，一般可以起到补肾的作用，当脾肾功能充足后，脑发育不良的情况可以得到明显的改善。
通常来说，软骨发育不良建议进行药物治疗、手术治疗等。
软骨发育不良的临床上并没有特殊的治疗手段，只能通过对症的治疗，建议通过使用生长激素的方式进行一些改善，虽然并不能彻底治愈这种病，但是有助于控制病情发展。此外，软骨发育不良可能会导致腰椎管狭窄，出现神经根或脊椎受压的情况，需要采取外科手术，比如椎板切除、减压、椎间孔增大等。
检查显示睾丸先天发育不良，没有什么特别好的治疗方法。网上所谓的基因修复疗法应该也没有什么明显的治疗效果。可以到正规的医院咨询一下，看看通过注射雄激素的方法，能不能促进睾丸的再次发育。
髋关节发育不良的治疗，应该来说是贯穿于整个疾病之中，在早期，如果在婴幼儿期就发现存在髋关节发育不良，可以通过这人字石膏，甚至儿科有专门的治疗髋关节发育不良的一些手术。
