输尿管结石微创手术方法包括输尿管镜和经皮肾镜手术。输尿管镜手术，通过输尿管软镜技术将输尿管或肾中结石取出，不适用于较大的结石；经皮肾镜手术，从腰上肾的部位打一个小孔，直到结石部位，通过特殊的器械和方法，把结石打碎，从小孔取出。体外冲击波碎石，又称微波碎石或震波碎石，是较常用的方法，具有花费小、损伤小、恢复快和费用低等优点。
通常在7天-10天会拔管，输尿管内也会放一个双接管，需要病患出院带回家，在手术后一个月，再到医院进行拔除。体内有双接管要少活动、勤排尿，避免双接管摩擦膀胱内壁引起疼痛和血尿。
输尿管结石手术，常见的就是输尿管镜钬激光碎石、输尿管切开取石、腹腔镜切开取石以及经皮肾镜手术碎石取石，这些手术都需要麻醉，手术后都需要留置DJ管在输尿管内支撑，所以这些手术后患者不能有效的排尿，所以必须要留置尿管。
这术后血尿的现象主要还是膀胱毛细血管没有完全康复的原因导致的，有可能是活动性出血，还是尽快到医院复查最好，每天早上空腹喝一大杯温开水再配合喝点梨炖冰糖水，做b超检查确定情况。
做完输尿管结石手术腰疼正常，绝大多数做完手术腰部不会疼痛，症状会明显的缓解。有一部分会有腰痛，主要就是输尿管支架管的耐受性不好，有残留的小结石往下移动，导致刺激症状引起疼痛。
输尿管结石术后疼痛与是否放置引流管、结石残留、输尿管痉挛有关，术后常见的临床表现为尿频、下腹部不适、血尿，可以使用α受体阻滞剂进行解痉治疗，缓解平滑肌的收缩。部分残留较小的结石，排石过程中也会出现疼痛，需注意是否造成石阶，可通过重置尿管或二次碎石等方式进行缓解，尤其操作部位水肿常导致腰部疼痛，建议放置输尿管导管解决肾积水。
