一般情况下，宝宝霉菌性肠炎，可以通过以下几种方式进行治疗。具体情况分析如下：
1.需要进行相应的辅助处理，如果是霉菌性肠炎，会导致大便的数量增加，导致体内的脱水和电解质出现问题，需要通过服用补液盐来进行补充。
2.还可以服用益生菌，比如霉菌性肠炎，主要是由肠道菌群失调所致，可以使用益生菌进行调理。
3.还可以口服氟康唑，这类药物主要用于治疗霉菌，具有一定的抑菌效果。
其主要的临床表现为腹痛、腹泻、稀水样便、黏液血便，部分的人可能会有发热、里急后重，也就是排便不尽等感觉，部分病人可能会有鲜血便。要多吃些清淡的，有营养的食物。不能吃辛辣生冷或者是比较油腻的食物。多喝温水，多运动，不要熬夜，注意保暖。每天坚持喝小米粥。
小儿霉菌性肠炎多为白色念珠菌所致，2岁以下的婴儿多见。常并发于其他感染或者是肠道菌群失调时，比如伴有呼吸系统的感染，长期应用抗生素以后容易引起本病，病程迁延，常伴有鹅口疮。症状主要是大便次数增多，黄色的稀便，泡沫较多带黏液，有时可以见豆腐渣样的细块，也就是菌落。大便镜检有真菌的孢子和菌丝，如芽孢数量不多，应该进一步以沙氏培养基做真菌培养确诊。
主要是考虑不注意清洁卫生，进食不洁食物引起的肠道感染，主要是霉菌等引起的。可以要对症治疗，可以使用杀菌药物，杀灭霉菌等，促进肠道有益菌群生长，平时餐具要消毒，注意清洁卫生。
婴儿霉菌性肠炎，多为念珠菌感染所致，此菌属条件致病菌，常发生在应用多种广谱抗生素或免疫抑制剂后，导致肠道菌群失调或机体免疫功能下降，或发生在早产儿、营养不良、久泻不愈的弱体儿。霉菌性肠炎的腹泻特点是大多发生在应用抗生素治疗后，轻者腹泻水样，重者水便中可见漂浮脱落的伪膜，甚至泻下血样便，每日可达10次以上。
