消除易感因素疗法，如避免长期使用抗生素、免疫抑制药、解除尿路梗阻，控制糖尿病等使机体抵抗力下降的疾病，尽量减少导尿及长期保留尿管等。针灸疗法，适合脾肾两虚者，可选用脾俞、肾俞、足三里、中极、关元、命门等穴，用补法。
手术方法治疗，包括细针穿刺抽液和开放手术，前者系在B超指引下用长穿刺针从皮肤刺入囊肿，吸出囊液。对症治疗，应用碱性类的药物，可降低酸性尿液对膀胱的刺激，抑制平滑肌细胞类的药物，可解除膀胱痉挛和缓解刺激症状。
药物治疗，应及早使用有效、足量的抗生素以控制感染，肌注或静脉滴注，可促使喉部组织消肿，减轻喉阻塞症状。强化治疗，患有喉炎的小儿多因呼吸不畅，而哭闹不安，不愿进食，时间长就会引起脱水，此时应给予补液；保证营养也是有助于病情缓解的辅助治疗。
中药疗法：进行辨证施治，其治疗原则是急则治其标，多祛湿利水，缓则治其本，温补脾肾是其关键；病因治疗：主要是针对引起脑积水的原因进行处理，例如切除引起脑积水的肿瘤，清除引起脑积水的血肿，摘除引起脑积水的脑囊虫等方法。
药物治疗，主要是使用抗生素药物，对于肾囊肿染病病因进行用药，控制症状；肾脏囊肿去顶减压手术，手术创伤小，另外，如果是不能耐受手术治疗的患者可以采用囊肿穿刺抽液治疗。
