喝咖啡不会造成肝脏负担，咖啡中除了含有大量的咖啡因外，还有一种叫做抗氧化剂绿原酸的生物活性化学物质含量极高，这种物质联通咖啡本身富含的蛋白质、氨基酸、甘油三酯、游离脂肪酸、钾铁锌等共同作用于人体，能让人体中谷丙转氨酶降低，因此降低部分肝病的发病率。
早晨空腹喝咖啡对身体不好，早晨喝咖啡的确有助于头脑清醒、精神抖擞，但须先吃早餐后，才能饮用，否则容易伤害肠胃功能。即使再习惯喝咖啡的人也不能空腹或在接近空腹的状态下饮用咖啡，那样会出现心慌头晕头疼恶心浑身乏力等不舒服的症状的。
年轻人相比成年人更容易受到影响，原因在于他们的身体往往不够成熟，另外年轻人对含咖啡因饮料的热衷程度也较高。摄入咖啡因之后其在身体中能够存在长达6个小时之，年轻人在饮用这些饮料之后体内正常血糖代谢机制会遭到持续的干扰，从而会导致将来发生代谢异常的风险增高。
经常喝咖啡，需要看咖啡因带来得收益和风险问题。咖啡因的效应和体重已经敏感度相关。咖啡因属于中枢神经系统兴奋剂，除了减肥，大多数人饮用咖啡也能保持清醒，提神醒脑。长期饮用时副作用包括，失眠、心跳加速、胃部不适、血压升高、偏头痛、紧张、焦虑、耳鸣、肌肉抽动、尿频、脱水钙流失等。敏感的人即使是少量的一两杯咖啡，也会出现以上表现。长期喝咖啡可能会造成耐受甚至依赖。
咖啡不适合有胃病的人饮用，有冠心病，高血压的人也尽量避免饮用。咖啡因会使人兴奋，血液循环加速，心跳加快，诱发冠心病发作。睡前少喝，会使人兴奋失眠，每天喝咖啡不要超过三杯。孕妇，哺乳期妇女和儿童不宜饮用。
如果胃酸分泌多、胃灼热，或者是有胃食管反流、肠胃疾病，对于咖啡这种刺激性的饮品，不要多喝，多喝反而容易伤害肠胃，按照自身的情况来判别。至于咖啡养胃，到目前为止，还没有相关的研究发现咖啡有这个功能，不要用咖啡乱养胃了。
