唇腭裂的治疗主要是通过整形来恢复口腔内的结构以及面部的畸形。但是选择什么样的手术方式以及手术时间还需要根据唇腭裂的轻重程度来考虑。最终的治疗目的是改善腭裂，恢复软腭的生理功能。术后还需要进行语言的训练来形成正确的发音。长大一些还需要到口腔科进行牙齿的矫正治疗。
可以通过手术到达良好的治疗效果的，但前提是必须按照序列治疗的程序进行治疗。可以利用咽后壁组织瓣增加软腭长度，利用咽侧组织瓣缩小咽腔宽度，以改善腭咽闭合。也可以利用裂隙邻近组织瓣封闭裂隙，延长软腭，将错位的组织结构复位，以恢复软腭的生理功能。
唇腭裂是一种先天性发育问题，可能是由孕妇在妊娠早期接受的放射性物质或病毒感染引起的。一旦确诊，需要进行外科修复，这可能会影响病人的正常饮食和发音。重症病人的手术可能不会一次完成，而二期甚至三期的手术需要在后期进行。
主要病因有：母亲怀孕早期感染流感病毒、风疹病毒；遗传因素；怀孕期间服用镇静药、抗癫痫药、激素类药或大量接受X线照射等。主要表现为出生后上唇和上颚裂开成两瓣或三瓣，唇裂手术时间为生后3个月。腭裂为生后18个月。
唇腭裂多是基因遗传性疾病，也有的是妊娠早期病毒感染、饮酒、药物及放射线引起的基因突变导致的。等宝宝大点可以采取手术的治疗方式，术后多休息，使用一些消炎药，预防消炎，伤口定期用消毒液消毒，不会影响美观的。
