病毒性心肌炎主要根据起病前肠道或呼吸道感染病史确诊，心脏损害临床表现，心肌损伤标志物呈阳性。
还有一些辅助检查提示心肌损伤，病原学检查呈阳性。临床上诊断病毒性心肌炎应予考虑，诊断主要依靠心内膜心肌活检。根据患者有无症状和体征来确定是否存在心力衰竭，心律失常和急性心肌梗死，并及时采取积极治疗措施。还应重视鉴别诊断，在兼顾病毒性心肌炎确诊时，β受体功能亢进应排除，甲状腺功能亢进等，二尖瓣脱垂综合征及其他累及心肌的疾患如冠心病等，结缔组织病、代谢性疾病、克山病等，药物和毒物等对心脏造成损害。
另外还需要结合临床表现，对患者进行全面综合分析，才能做出正确的判断。检查时可采用实验室检查，包括血液生化检查等，病毒血检查和辅助检查包括心电图、x线等，超声心动图等。
通常情况下，小儿病毒感染性口炎，家长应带小儿做组织病理学检查、检测血清抗体、血常规检查等检查。具体情况分析如下：
1.组织病理学检查：小儿病毒感染性口炎，家长应带小儿做组织病理学检查，来判断小儿是否出现了口腔面膜病损的情况。
2.检测血清抗体：小儿病毒感染性口炎，家长应带小儿做检测血清抗体，来帮助医生进行诊断。
3.血常规检查：小儿病毒感染性口炎，家长应带小儿做血常规检查，来判断小儿是否出现了白细胞总数减低的情况。
如果儿童EB病毒感染，通常要遵医嘱做体格检查、血常规检查、血清学检查等。
1.体格检查：体格检查通常用于初步诊断病情，如果儿童EB病毒感染，通过体格检查可以发现在扁桃体表面有白色渗出物或假膜形成，躯干部皮肤可能会出现丘疹、斑丘疹等皮疹。
2.血常规检查：当出现儿童EB病毒感染的情况，可以采取血常规检查，白细胞总数轻、中度增高，并且单核细胞、淋巴细胞占60%~90%，而且异常淋巴细胞>10%或绝对值超过1000x106/L具有诊断价值。
3.血清学检查：儿童EB病毒感染需要进行血清学检查，抗VCA-IgM是急性原发感染的重要指标，通常出现在病程的第1周，持续4~8周左右。抗VCA-1gG早期也升高，通常阳性表明既往或正在感染。
妊娠合并微小病毒感染首先要做产前腹部超声波和MRI：根据产前腹部和MRI的表现，可以确定胎儿的生长和感染的程度。入股大部分羊水都是正常的，胎盘较大，而胎儿会牵扯的发育也是很好的。一般可见胎儿水肿，胸腔积液，心包积液，皮肤增厚。贫血会引起未免疫的浮肿、轻度或严重的贫血症，而在胚胎的脑中血管的最高流量则会升高。情况即为严重时，会出现胎心增大，胎动降低。
通过实验室检查：怀孕28周以内，可以进行B19-DNA的介入检查。血液、羊水及其它组织样本B19-DNA可以采用荧光-PCR技术进行检测。妊娠期间未出现长期的病毒血症、或未发现胎儿存在畸形，或已怀孕超过28周。
柯萨奇病毒可以导致手足口病，也可以导致疱疹性咽峡炎。如果病人没有发热，咽峡炎没有导致咽痛、没有影响进食，手足部和其他部位的皮疹没有出现破溃感染，并且精神状态良好，可以不进行任何治疗。因为手足口病和疱疹性咽峡炎都是自限性的疾病，一个星期左右，这些症状都能够消退。
