一般情况下，宝宝半夜和早上醒来才咳可能是以下原因导致的：
在深睡的时候，宝宝的大脑皮质会进入充分的休息和深度的压制，从而控制咳嗽的中枢，进而可以有效地控制在深睡觉的时候不会咳嗽，在浅睡的时候，由于大脑皮质的一部份工作，导致咳嗽的作用会降低，从而导致半夜和早上醒来才咳。因此，宝宝半夜和早上醒来才咳，这是因为宝宝的咳嗽反应没有被压制。
不能从咳嗽的具体时间来判断是热咳还是寒咳。不管是热咳还是寒咳，早晨都会有咳嗽。热咳的主要症状是痰液粘稠，呈黄色，不易咳出，同时还会伴随有咽干疼痛、口鼻干燥、口渴等症状，还会出现发烧、头痛、头晕、舌红苔薄等症状。这种情况下可以用豆腐皮泡水喝，对肺热咳嗽有很好的治疗作用。寒咳的主要表现为痰液稀薄，不是很粘稠，咳嗽时会出现干咳、痰少等症状，主要是受凉导致的，可以服用白萝卜生姜水等温补的药物。
这可能是属于一种内环境紊乱的表现，和空气干燥，喂养不当等原因有关系，咳嗽不明显也不频繁，可以先注意观察，平时要注意给孩子多喝一些水，多吃一些水果，蔬菜比较好，通过宝宝自身的调理多会慢慢好转。
早上起来胃胀气考虑是由于以下几种原因造成的：
第一种是因为消化功能差，可以服用健胃消食片，避免食用油腻的食物。
第二种情况，是因为肠胃蠕动不畅，可以服用吗丁啉，早上起来喝一杯清淡的生理盐水，可以帮助胃肠道排出。
第三个原因，可能是因为昨天吃了一些容易生气的东西，比如洋葱、红薯，可以遵医嘱服用多酶片。
早上第一口痰是褐色，一般常见于慢性咽喉炎刺激所导致。因为痰的颜色是褐色，一般和呼吸进入的灰尘是有关的。另外，还要考虑痰本身含有血液成分，比如可能还要考虑肺结核、肺癌、肺部的肿瘤，肺部的其他的占位性病变，还要考虑消化系统方面的问题比如反流性的胃食管炎，以及心血管方面的问题比如心功能衰竭而导致的粉红色泡沫痰的肺水肿，也要考虑。
考虑可能是因为晚上经常受凉以后导致有一些寒邪阻滞经络，同时可能是一些腰肌劳损为主，可以到医院进一步检查。治疗上可以适当外用一些通经络的药膏，具体用药请遵医嘱。也可以选择做一下中药熏蒸等治疗。
