先天性心脏病一般与发育有关，所以治疗一般是选择手术治疗，只是根据情况，首先是判断是否能做手术，其次是确定什么时候做手术最合适，然后做出全面的判断，然后才会给出一个计划。
室间隔缺损小于0.1-0.3cm时没有任何临床表现其不需要特殊治疗，在1岁半左右可以自行修复。对于缺损比较严重的患儿采用介入治疗和手术治疗，药物治疗可以积极地防止感染性心内膜炎的发生，也可以防止心力衰竭的发生。进行手术治疗需要择期进行，最佳手术年龄在3岁左。
绝大多数简单的非紫绀型先天性心脏病能够治好：如室间隔缺损、房间隔缺损、动脉导管未闭，占先天性心脏病的50%以上，经过外科手术或介入手术能够治好；较复杂心血管畸形的紫绀型先天性心脏病如法洛氏四联症，是紫绀型先心病的代表。手术效果不如室间隔缺损，房间隔缺损；更复杂的心血管畸形如单心室、三尖瓣闭锁，手术效果最差。心血管畸形程度越大，治好可能越小。
先天性心脏病可以分为三大类，分别为左向右分流型的，在正常现象下体循环的压力是高于肺循环的，右向左分流型的，某些原因导致了右心室的压力升高并且超过了左心，从而使血流从右向左分流，无分流型的也就是左右两侧或者说动静脉之间没有出现异常的通路或者是分流。
室间隔缺损是小儿最常见的先天性心脏病。正常如果说小于五毫米的缺损在三周岁之内会自习慢慢愈合的，不着急手术，超过五毫米的可能就需要手术治疗，都是选择介入封堵手术属于微创手术。
先天性心脏病最常见是患儿生长发育明显的落后、体重增长缓慢、体格瘦小，小婴儿表现为吃奶无力、容易出汗，在秋冬季节，这部分患儿可能反复的呼吸道的感染、反复的肺炎，一旦肺炎还容易发生心力衰竭。还有一大类的患儿生长发育不受影响，可能也不会经常有肺部的感染，但是这类患儿临床可看见口唇、手指、脚趾末端甲床青紫，一旦发现青紫，这类患儿常常是复杂型的先天性心脏病，需要到医院做超声心动图来明确的诊断。
