治疗便秘可以按摩宝宝腹部，在感觉到较硬的部位可能是停滞的大便时，要稍加用力向下推，促进排便。还可以用手指蘸取婴儿油，轻轻按摩，宝宝肛周刺激排便。还可以按摩足三里，足三里是胃经上的一个主要穴位，常按揉有保健，促进消化的作用，按揉100次，促进宝宝排便。
新生儿便秘多与食物的成分关系密切，如果食物中蛋白质含量过多，糖类不足，使肠发酵相对减少，使大便呈碱性、干燥，导致便秘，也有可能是由于小儿食量太少。经过消化后，肠道中的余渣少，导致大便减少；也有可能是由于生活和排便不规律，排便反射形成减弱，或者不形成，导致便秘的发生，也有可能是先天性无肛、先天性巨结肠等多种原因导致。
便秘是婴儿经常出现的病症，其原因很多，概括起来可以分为两大类，一类属功能性便秘，这一类便秘经过调理可以痊愈；另一类为先天性肠道畸形导致的便秘，这种便秘经过一般的调理是不能治疗的，必须经外科手术矫治。绝大多数的婴儿便秘都是功能性的。
经常会出现便秘的症状，可能是与胃肠功能紊乱，或者是肠道疾病的原因导致的。所以如果小孩出现经常性便秘，可以考虑服用药物进行调理，必要时进行消化道钡餐透视看看确定具体的原因。
新生儿出现便秘的问题，如果是大便干引起的便秘可以使用药物，但是不能频繁的使用，其他情况不建议使用药物治疗，以免加重孩子的不适症状。建议带孩子去检查确诊，再对症治疗。