百日咳综合症的临床表现通常会先有流鼻涕、流眼泪、发热、轻度咳嗽等，然后慢慢的咳嗽会逐渐加剧，2个星期后会出现抽搐性的连续咳嗽，以夜晚居多，如果病历比较久，会引起声带水肿，并伴有鸡鸣样的尾音，也会有口嘴唇发青、呼吸困难等。通常情况下，一般是见于6个月内白百破疫苗还没有接种完全的婴儿，可以口服阿奇霉素、红霉素等大环内酯类的药物来治疗。
百日咳的常见症状是咳嗽，通常为痉挛性咳嗽和阵发性发作，咳痰少。剧烈咳嗽可能导致声音嘶哑或恶心呕吐。需要验血来确认诊断。不要吃辛辣的食物或生冷的食物。多喝白开水是有帮助的。
应立即隔离并应用抗生素进行治疗。出现呼吸困难时，应及时吸氧，伴有咳嗽，痰多症状时，可以应用止咳化痰药物进行治疗。百日咳的主要临床表现为阵发性，痉挛性咳嗽，并伴有深长的鸡鸣样吸气性吼声。
小孩百日咳的典型症状是阵发性、痉挛性咳嗽，咳嗽终末出现深长的鸡啼样吸气性吼声。一般发病比较缓慢，得病初期有低热和感冒的症状，咳嗽逐渐加重，以夜间为重，一周后出现阵发性一连串痉咳，并伴有吸气性吼声，反复发作，虽然咳嗽严重但是肺部多无异常体征。
第一期是卡他期，主要表现为类似感冒的症状，第二期为痉咳期，一般持续2-6周，咳嗽的特点是成串的、接连不断的痉挛性咳嗽后伴一次深长吸气，同时发出一种特殊的高音调鸡啼样吸气样吼声，第三期为恢复期。
