要到医院进行检查囊肿的大小，性质，增长速度等进行相关的治疗。腹腔镜下卵巢囊肿剥离术不需开腹不切除卵巢可最大限度保留生殖器官完整性及生育功能。腹腔镜手术治疗，再监测卵泡。在排卵期性生活怀孕几率最大。
卵巢巧克力囊肿初期可以通过手术治疗。巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到盆腔内的卵巢、附件后，每次月经期时，异位的子宫内膜细胞也少量出血，出的血又不象子宫内的月经血有通道排除体外，而是由腹膜包裹，再出血再包裹，月复一月地积聚，其间也由腹膜吸收一部分，剩下的变成一种陈旧性积血，颜色如同巧克力样地咖啡色，因而得名为巧克力囊肿。
卵巢巧克力囊肿复发的原因有很多，除了手术不成功处，还有就是在手术后不注意护理，也会使疾病复发。注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常，月经期要做好自身的保健，注意控制自己的情绪，不要生闷气，否则会导致内分泌的改变等。
巧克力囊肿是会导致不孕的。至少会造成排卵障碍。卵巢巧克力囊肿的形成是由于内膜在卵巢中仍然会出现“经血”症状，但由于在卵巢内无法排出，日积月累就造成了旧血的长期潴留，形成囊包。
建议直接到医院检查，巧克力囊肿复发会导致一系列的妇科问题，包括慢性阴道炎等，如果巧克力囊肿真的复发了，需要引起重视并且再做一次手术切除。平时的时候需要注意个人清洁和卫生，不要和其他人共享洗浴用品。
巧克力囊肿可采用腹腔镜手术，在腹腔镜下对囊肿进行切除。术后打针阻断内膜异位症的复发，阻断巧克力囊肿复发可以用一些药物。手术刀口较小，对身体的损伤和痛苦也会小很多。
