第三针乙肝疫苗在第二针疫苗接种五个月后接种。乙肝疫苗全程接种三针，免疫程序为0、1、6.即当天接种一针，一个月后注射第二针，六个月后注射第三针。第二针与第一针间隔28天以上即可接种，第三针与第二针间隔3个月以上即可接种。在规定的免疫程序最上限时间不超过1个月都可接种，如果超过最上限1个月后接种可能会影响抗体的产生。
乙肝疫苗是灭活疫苗，是按照0、1、6月的程序接种，乙肝疫苗的第一针和第二针之间至少要间隔28天，第二针和第三针之间间隔应大于等于60天，晚了也可以接种第三针乙肝疫苗。乙肝疫苗是刺激人的身体产生保护性的抗体，对乙肝病毒有免疫力。乙肝抗体一般的要3-5年复查一次，需要根据结果来进行决定是否需要加强乙肝疫苗的注射。
乙肝疫苗一般打3次，3次间隔0-1-6个月。
若首次注射疫苗时间若2.5，则第2次接种时间为3.5，后3次接种时间为8.5。因为这三个时间段都会影响到乙肝表面抗原抗体水平。因此，关于第3次接种疫苗时机，需综合考虑首次接种时间。一般情况下，要根据实际病情进行判断，如有特殊状况则不允许接种。原则上不应超前，2次接种时间可适当增加，不可能预先接种。
新生儿出生以后按照016的方案来进行疫苗的接种，接种完第一针以后30%的人可以有效产生抗体；一个月以后进行第二针的接种，接种完第二针有60%到70%的人可以产生有效的抗体；第二针也是非常关键的一针。如果因为一些特殊的原因，导致注射第二针疫苗的时间延迟，但是时间不可超过一个月，如果超过一个月，将会明显的影响到免疫效果，需要重新进行全程的疫苗接种。
乙肝疫苗注射的第一针是在小孩出生当天，即小孩分娩出来后的24小时内，越早注射越好，第二针在出生后的第二个月，然后第六个月注射第三针，这是正常注射乙肝疫苗的方法。另外现在为了减少母婴传播的概率，还要打乙肝高效价免疫球蛋白，共打两针，出生当天和出生后的第二个月各打一针。
