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发烧咳嗽多与上呼吸道感染、气管—支气管炎、肺部感染、肺结核、肺癌等疾病有关，需要进行做血常规、胸片、胸部CT、C反应蛋白等检查，明确病因，对症治疗。考虑是合并细菌感染，适当的口服药物治疗。
先发烧后咳嗽，首先要考虑到呼吸系统常见的疾病，而引起的。发烧可以见于其他的一些常见的疾病，如胃部的疾病、泌尿系统的疾病都可以引起发烧。要根据发烧体温的度数高低和其他的伴随症状考虑。
婴儿发烧主要与感染有关。因此，婴儿应首先被送往医院进行血液检测和抗丙孕酮检测，并根据结果考虑用药。如有必要，应考虑静脉用药进行住院诊断和治疗。首先，应该清楚诊断是治疗的关键。因此，去儿科，不要延误孩子的病情。如果中度发热的温度超过38度，可以考虑物理冷却治疗。
宝宝在感冒后比较容易出现咳嗽的症状，一般认为是患了咽炎或者是支气管炎的可能。要是宝宝出现反复发烧，就需要注意，如果是出现了小儿肺炎，是需要住院治疗的，平时多喝水。
由流感引起的发烧咳嗽等症状，患者可在症状出现后的黄金48小时内及时进行抗病毒治疗，临床常用药物有可威磷酸奥司他韦颗粒。
该药是目前各大指南推荐的流感防治药物，药物吸收后，其活性代谢产物转化率高，药效发挥迅速，通过抑制体内流感病毒的复制，可减轻病毒在体内扩散，能有效改善流感病情，从而缓解发热、咳嗽等症。
在发热、咳嗽期间，为避免水电解质丢失或咽喉不适加重，建议患者用药过程中增加饮水量，保持清淡的饮食结构，也有利于补充身体患病期所需微量元素，以促进恢复。
出现咳嗽不一定会发生发烧的症状。咳嗽是宝宝机体的自然的一种自我保护的动作反射。针对于呼吸道内的不仅仅是炎症分泌物，而且还针对于呼吸道内的异物的排出。当宝宝体内呼吸道内吸入异物，会出现咳嗽，努力的将异物排出。在呼吸道内有炎症反应，黏膜充血水肿，有过多的分泌物的时候，宝宝会咳嗽，可能会出现合并炎症感染引起的发烧。
