小儿百日咳情况下服用镇咳祛痰的药物来治疗，如果痰液比较粘稠可以选择雾化吸入，如果经过一段时间的治疗症状没有得到缓解，是需要进行检查对症治疗，平时要注意室内空气的流通，给孩子多吃易消化的食物。
小儿百日咳服用抗感染的药物最有效。百日咳可引起儿童呼吸道的感染，往往也会有不断的咳嗽声，发热等症状，临床中治疗的方法有很多对于免疫力不强的情况下，需要采取有效的措施，在患病期间需要保持充足睡眠，多吃易消化的食物。
百日咳是小儿常见的一种呼吸道传染，是由百日咳杆菌所传染。主要症状初期会有流涕、喷嚏、低热、咳嗽，之后这种临床症状会逐渐加重，有剧烈的阵咳，激烈咳嗽持续不断，严重会出现呼吸困难。如果以上症状持续出现，患儿呼吸会出现典型的鸡鸣声。百日咳如果不积极治疗，一般会持续百日左右，故而得名。百日咳这种疾病有一定的传染性，一旦诊断需要及时治疗。
需要按呼吸道隔离，保持空气新鲜，避免一切可诱发痉咳的因素。服用抗病毒药物，加强护理以预防并发症，注意营养。幼婴儿窒息时应即刻行人工呼吸，给氧，必要时给予止痉排痰。可用静脉滴注，以减少窒息或惊厥，需同时注意心率和血压。
小儿百日咳的症状主要表现为顽固性、持久性的咳嗽，咳的时候一般呈痉挛性咳嗽，且较为剧烈，还可能会满脸通红，伴有鸡鸣样尾声。还可能会出现呼吸黏膜受损伤，容易继发感染，出现发烧的情况。
治疗上，一般是针对百日咳杆菌进行抗感染治疗，常用大环内酯类抗生素，如红霉素或阿奇霉素等。同时家长遵医嘱可以宝宝服用止咳化痰类的药物进行治疗，也可以做雾化治疗，如布地奈德雾化溶液加沙丁胺醇雾化溶液。
第一期是卡他期，主要表现为类似感冒的症状，第二期为痉咳期，一般持续2-6周，咳嗽的特点是成串的、接连不断的痉挛性咳嗽后伴一次深长吸气，同时发出一种特殊的高音调鸡啼样吸气样吼声，第三期为恢复期。
