心房颤动的治疗是一个综合的治疗过程。首先，应该控制心室率，不要跳得太快。其次，它可以尽可能地转换成窦性心率来控制心率。最后应对所有房颤患者进行血栓栓塞风险评估。心房颤动最严重和最常见的并发症是血栓栓塞。评估后，应提供适当的抗凝和抗血栓治疗。
对于突发性快速房颤，首先需要判断是新房颤还是持续性房颤。如果是新的房颤，可以通过电除颤或静脉或新的心率来达到将其转换为正常心率的效果。如果是慢性持续性心房颤动，需要控制心室率。可以使用β受体阻滞剂或缓慢心率等药物。
持续性房颤的治疗涉及到其病因的治疗。与甲状腺功能亢进一样，甲状腺功能亢进可引起持续性房颤，因此治疗甲状腺功能亢进有助于持续性房颤的治疗。控制心室率，重建窦性心率，预防栓塞。由于地高辛能增加房室传导的延迟和阻滞，故通常可通过地高辛控制心室率。例如，独自地高辛不够有效。维拉帕米(维必定)最有效。
48小时内心房颤动可以直接复率，否则需要前三后四周的抗凝治疗，房颤治疗主要是控制心室率，复率，预防并发症三种，房颤发病和高血压，冠心病，瓣膜病，甲亢有关系。可以到心内科诊治，注意休息劳逸结合，避免焦虑，戒烟酒，避免刺激性食物。
心房颤动治疗强调长期综合管理，即在治疗原发疾病和诱发因素的基础上，积极预防血栓栓塞、转复并维持窦性心律及控制心室率，医生会根据病因、临床症状不同等给予药物、手术或者射频消融治疗等不同的治疗方案。
对于已不适合药物转复或药物及电复律转复失败的老年患者，治疗目的则是控制心室率。目前常用药物有洋地黄、β受体阻断药、钙通道阻断药、胺碘酮等。中医药对房颤的主要干预手段有药物治疗、针灸疗法等，例如参附注射液，温补心阳，安神定悸。用于心阳不振所造成的心慌不安、胸闷气短。
