腱鞘囊肿多数病例无须特殊处理，主动注意休息，以免局部受创伤，切忌重复推拿按摩。一旦发生腱鞘囊肿时，可以采取保守性的方法来治愈，主要包括手术以及药物治疗等方面。如局部有某种疼痛表现，并压迫血管神经，导致相应病症，或腱鞘囊肿渐大，此种情况需积极处理。
此外，患者日常应该避免摩擦患处，以免导致病症持续加重。
一般情况下，腱鞘囊肿没有可以使用的外用药，具体内容如下：
腱鞘囊肿主要是肌腱在鞘膜管内滑动产生黏液导致的局部的肿胀，没有出现在皮肤表面，囊肿是来源于关节腔，所以一般没有对症使用的外用药。通常可在医生指导下，采取挤压推拿，将囊肿按破，在里面的积液被逐渐吸收后，囊肿的情况也会逐渐消失。若囊肿没有消退或者有继续增大的情况，一般需采取手术治疗促使病情痊愈。
如果腱鞘囊肿患者没有出现明显不适症状，可以不进行特殊的治疗。若出现不适症状或并发症时布不治疗，可能会导致病情加重。
腱鞘囊肿是一种良性的肿瘤，一般不会对人体产生任何的伤害，所以不需要特别的处理。但如果是大关节的腱鞘囊肿，会影响到关节的运动，尤其是扩张之后会压迫到神经血管，那么囊肿就需要进行特殊的治疗，将腱鞘囊肿去除，以消除压迫组织，恢复四肢的运动，缓解四肢的麻痹，改善四肢血液循环。
通常情况下，腱鞘囊肿中医可以通过使用药物、针刺治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
使用药物：腱鞘囊肿中医治疗时，可以安静消炎镇痛膏、麝香止痛贴膏、云南白药膏等把膏药敷到患处，可以起到消肿化脓、活血行气的作用。
针刺治疗：腱鞘囊肿中医治疗时，根据囊肿的部位及症状，选择合适的穴位，可以很好的治疗腱鞘囊肿。
通常来讲，腱鞘囊肿采用扶他林治疗无效，其病因如下。
首先，腱鞘囊肿的发病原因多为结缔组织营养不良和退行性改变而成，而不是炎症病灶所致。其次是腱鞘囊肿的病变内有一定的间距，构成多房性囊肿且药物难以穿透，故不能起到治疗的作用。另外，扶他林是非甾体类抗炎药，对无菌性炎症起作用，但对无炎性反应的疾病如囊肿无效。
脚踝腱鞘囊肿可以通过针刺、药物治疗等方式改善。
脚踝腱鞘囊肿要根据囊肿的体积和局部的压力来决定，如果囊肿很小，直径小于2cm，可以采取保守疗法，比如在外用热敷，可以用针刺，进而可以对局部进行封闭，但是对于大的腱鞘囊肿，或是压迫到了周边的神经动脉，引起了足趾的麻木和痛苦。这时需要进行药物治疗，起到止痛的作用。
