肾结石要根据结石的大小、部位、不同的位置选择合理的治疗方法。如果结石比较小，可以通过微创手术，或者药物进行取石治疗。如果结石非常大，要考虑手术或者体外冲击波碎石，或者肾镜激光治疗的微创取石，具体要根据不同的情况。
治疗肾结石应对症治疗，同时积极寻找病因，按照不同成分和病因制定治疗和预防方案，尽量防止结石复发。可采取饮水、使用药物解痉止痛、使用药物控制感染等方法来治疗肾结石。
怀孕得了肾结石，要根据结石的大小、结石的位置以及是否引起肾积水做综合评估。若结石小于零点五厘米，要多补充水份，多排尿，可以有效的促进结石的排除。若结石大于零点五厘米，在肾脏内不要做体外震波碎石。若结石引起反复发作，导致疼痛和血尿，要及时去做处理。若结石反复发作，可在输尿管内留置双J管，这样可以有效的缓解疼痛，有效地防止结石掉到输尿管，有效的缓解症状。
肾结石的治疗是要根据结石的大小来决定，相应的治疗措施。可以考虑先药物排石治疗，口服一些能够排石的药物，吃药的同时需要多喝水，小的结石是有可能排泄出来的。但如果结石进一步增大，需要考虑其他的治疗措施。
肾结石症的在临床上非常多见。很多经过手术或非手术治疗，结石暂时得以去除。但不久，又会生成新的结石。如果尿结石不大，直径小于1厘米，无尿路感染或梗阻现象，肾功能尚好者，可试行不开刀的方式治疗，包括多饮水、多活动，多跳动，以及服用有利于结石排出的中药。充分饮水，保证每日有1500ml的尿量，不要憋尿，尤其注意夜间也要适当饮水，饮水既可防止尿结石，又可有助于较小尿结石的排出。怀孕期间如果肾结石没有什么症状可以不用去管，如果有疼痛不适可予解劲止痛药对症治疗。
如果出现双肾结石小颗粒，应该通过以下方式进行处理。
第一，最好是及时去正规的医院进行详细检查，以清楚双肾结石的情况，具体这个小颗粒的大小。其次在做相关诊断之前需要先确定是属于哪一种类型的结石。再按此结石位置，及结石有无形成梗阻等这几个方面做详细的分析，确定接下来的治疗方案。在这一过程中，要注意观察病情变化情况，如果是不需要手术或者是其他特殊处理的话，一般都会采取保守治疗方式。一般情况下，对较小肾结石可采用保守治疗，便可能排出结石。如果是需要手术的话，也要在医生指导下实施相关措施才能达到目的。如某些排石药物，使患者大量饮水和小便，适当的锻炼，这些小颗粒肾结石很可能被排出。当然也要有所防范，例如，使患者养成好习惯，养成好饮食习惯，对于防止肾结石反复发作将大有裨益。