肛周脓肿由于肛周腺体出现炎症反应造成，不能自行愈合，早期时可以通过保守治疗达到治疗，如脓肿尚未形成时，可通过卧床休息，给予相关类抗生素联合，可给予温盐水坐浴，局部理疗，口服缓泻药物软化大便，减轻排便时疼痛等手段控制感染，待脓肿炎症控制后症状可逐渐消失。但是脓肿一旦形成症状较重时，应尽早切开引流，必要时将内口一并处理，以免术后形成肛瘘。
新生儿肛周脓肿形成的主要原因是肛隐窝感染，往往是在腹泻以后出现。大多数的婴儿在肛门边缘，大约一大两厘米的地方，会有漏斗样的结构，称为肛门腋窝。如果新生儿出现了腹泻或者大便不成形，大便残渣就容易残留在肛门隐窝里。大便残渣里会有大量的细菌，婴儿的抵抗力比较弱，很容易引起肛隐窝的感染。如果出现了感染，会通过肛管侵蚀并蔓延到肛周皮肤，从而形成婴儿肛周脓肿。
肛周脓肿是常见的肛门直肠周围感染性疾病，通常是由于肛窦炎引起的肛门周围软组织脓肿形成。表现为局部红肿，疼痛，波动感。肛周脓肿不算太大型的手术，只是切开把脓放出来，让伤口从里往外长，这种就可以了，一般恢复期需要至少两周的时间，伤口才能开始愈合。
婴儿肛周脓肿需要保持好良好的大便，避免过于稀淌的大便，大便完成后，需要给予及时的清洁，坚持温水坐浴。观察患儿肛周的红肿状况，感觉皮肤菲薄、有明显的波动感，需要及时进行切开引流。
虽然孩子比较小，但是还是手术好一些的，恢复也比较快。疼痛多少都会有的，要是没有全身症状的话可以用中药贴敷，配合西药消炎治疗试试，效果不好的话就要尽快的手术治疗的。
可根据不同情况采用保守治疗或手术治疗，即使是手术治疗，也是创伤小，痛苦小，恢复快。如果没有及时治疗或者治疗不当，可使病程经久不愈，继而引起复杂性肛瘘或直肠瘘，给患儿造成更大的痛苦。如果已经成脓并熟透，是要切开排脓的。如果没有成脓那就坚持打合适药物直至治好，以免造成脓毒。
