巧克力囊肿一般术后不会复发的，配合生活方面注意就可以了。平时一定要注意休息，饮食要清淡，多喝水，多吃青菜和水果，不要吃生冷辛辣的食物，注意腹部的保暖，定期做好复查，有情况要及时去医院处理。
巧克力囊肿的复发几率还是非常高的。在临床上，如果巧克力囊肿的病人术后没有给予相应的干预，绝大多数都会出现复发的情况。主要是因为巧克力囊肿由具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢，才引起的这种囊肿，手术很难把这种活性细胞完全根除掉，所以就会复发。
这样的病症如果是通过手术治疗之后，又复发了，应该查找其复发的原因。可以去检查一下体内的激素水平，看看是不是有这类的原因引起的，如果与此有关，就要调理自己的内分泌状态。
巧克力囊肿在三年内复发的几率约为14%，而在三到五年内复发的几率已上升至40%。卵巢囊肿的治疗取决于年龄、症状是否恶性、囊肿的位置、大小、生长速度、子宫附件的变形、生育功能是否得到保留以及病人的主观愿望。
是能治好的，但目前巧克力囊肿除了手术外，尚无一种理想的治疗方法。无论是药物治疗抑或保守性手术均有相当高的复发率。要想治好还是得找到源头去切除。手术方式有开腹手术和经腹腔镜手术两种。腹腔镜手术是本病较好的处理方法。目前认为以腹腔镜确诊、手术+药物为内异症治疗的选择。
巧克力囊肿穿刺后是要做手术标本检查的，在术后要避免着凉感冒，要注意自身的保暖，调整自己的情绪，保持一个乐观开朗的心态，可以使生体的免疫力也正常，要禁止所有的剧烈运动以及重体力的工作，饮食吃些容易消化和吸收的食物，食用适量的水果和蔬菜以提高自身的抵抗力，不要食用容易胀气的食物。
