口腔溃疡的治疗以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。
每个月都口腔溃疡是微量元素的缺乏，是由于营养不良或者是贫血，或者是机体抵抗力较低，尤其是女性月经期，特别容易产生口腔溃疡，或者是疱疹的症状提高自身机体抵抗力，合理膳食，并且补充维生素。
用消毒棉签蘸粉末敷患处，一般用药3天后恢复，将维生素C研成粉末状，若系小溃疡，仅需取少许敷于患处即可，若溃疡面较大，则应先轻轻刮除溃疡面渗出物，然后再敷药粉，用针刺破维生素E，将药液挤出涂于口腔溃疡处，保留1分钟，每日用药4次可恢复。
蒲公英对于口腔溃疡是有一定的缓解作用的，蒲公英有一定的清热解毒的作用。如果口腔溃疡情况比较严重，疼痛剧烈，最好喷涂一些喷剂在患处，这样溃疡会愈合的更快一些。
口腔黏膜长时间出现迁延不愈的溃疡，或者在一段时间内出现溃疡的面积增大并伴有肿块，同时黏膜的表面出现不光滑、凹凸不平，常伴有粗糙、鳞形或者片状脱屑，时常也有渗液或者渗血以及伴有异常味道的，则高度可疑口腔黏膜有癌变的可能性。
口腔溃疡的发生与免疫力低下，维生素缺乏感染有关，溃疡具有自限性，7-10天可以恢复，多吃蔬菜水果补充维生素，提高免疫力可以减少口腔溃疡的发生。反复发生的口腔溃疡，可以适当的应用激素类药物进行治疗，不要吃刺激的食物。
