肛瘘的治疗以手术治疗为主，药物治疗只适用于手术期的调理。肛瘘手术后由于创面相对比较大，每次排便都会污染伤口，所以在饮食方面尽量不吃辛辣刺激油腻燥热的食物，以免引起肛周分泌物增加，增加术后感染的风险。同时对于生冷、腌制的食物也要尽量的避免。应该多吃些富含维生素和优质蛋白的食物。
脱肛不应当吃或少吃辛辣刺激性食物，如白酒、黄酒、辣椒、胡椒、大茴香、蒜、葱及鱼、虾等肥甘厚味、炙烤食物。这些食品可刺激直肠肛门部的粘膜皮肤、使充血明显、加重脱出。饮食上多吃蔬菜、水果、多饮水，不吃易上火的食物，戒辛辣食物和酒，以保持大便不秘结。防止便秘，经常变换旅行中的坐、立、站姿势，蹲厕不要过久。
选择鱼、瘦肉、奶类、豆制品等含优质蛋白质且胆固醇含量相对不太高的食物，控制动物肝、肾、脑或鱼子等食品摄入，保证新鲜蔬菜、水果的供给。绿叶蔬菜，可提供必要的维生素和适量纤维素，更应保证。酸奶、山楂、糙米等食物也对病人有利，减少动物性脂肪摄入，如肥肉及动物油脂，适量增加玉米油、葵花子油、花生油、豆油等植物油摄入比例。
平时大便必须通畅，避免干燥，可以口服一些药物辅助排便，养成规律排便习惯，饮食清淡，避免辛辣刺激食物以及油腻饮食，经常腹部按摩，锻炼身体，练习提肛运动等。中药内服外敷。可以口服一些。补中益气的中药，局部，中药坐浴。
要吃辛辣刺激性食物，如辣椒、大蒜、花椒等。少吃生冷、油腻及寒性的食物，如肥肉、大油汤等。经常腹泻的病人不要吃蜂蜜、生葱、大蒜以及黄豆类、土豆、萝卜等使肠道蠕动和产气类的食物，也不要吃芹菜、韭菜等粗纤维有通便作用的食物。
