以消除病因、增强体质、对症治疗为主。治疗方法应该坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合，对症治疗。口服维生素B、C和增进机体的抵抗力，有助于溃疡的愈合。
清洁口腔后，用消毒棉签将蜂蜜涂於溃疡面上，15分钟左右后，可咽下，再继续涂拭，一天可重复涂拭数遍，也可以取一到三维生素片研成碎末，覆盖在溃疡面上，不到十分钟即可解除疼痛，不出半天就好了。这种治疗方法效果比较显著。
口腔溃疡根据病因不同，治疗方案也不同。如果溃疡由创伤引发，可通过去除刺激因素，同时促进溃疡愈合进行治疗。如果是复发性阿弗他溃疡，治疗方案比较复杂。常见药物为免疫抑制剂或漱口水等，病人可口服或外用。需要注意，复发性阿弗他溃疡，服用抗生素治疗无效，所以病人要在医师指导下服用药物，切忌自行服药。
可以去内科进一步检查平时要注意保持口腔卫生，早晚刷牙，饭后用淡盐水漱口，平时要均衡饮食，合理搭配，补充多种微量元素，少吃辛辣生冷油腻刺激性的食物，多吃新鲜蔬菜水果。
口腔溃疡治疗一般是对症治疗，局部用治溃疡的药物，然后全身增强免疫力，加强体育锻炼增强体质。如果是精神因素造成，要自我调节，不要熬夜、挑食，多吃蔬菜、水果。也可以使用激光进行口腔溃疡的治疗，在诊室用激光对溃疡进行照射。
口腔溃疡很容易复发，所以不能够完全的治疗，但是可以通过正常的休息，锻炼，调节好心情，饮食来减少复发的可能。一定要尽量做到规律作息，保证睡眠，适当的体育锻炼，保持口腔清洁，饮食全面适度，多吃含维生素和微量元素的食物。
