主要治疗方法包括药物保守治疗、透析和肾移植。发现尿毒症时，及时到肾内科就诊，并注意监测肾功能、电解质等。早期积极治疗可能会阻止或延迟透析。在指导下用于保守治疗的常用药物包括肠道吸附剂、灌肠剂、改善肾血流量和抗酸剂。
目前有血液透析、腹膜透析和肾移植三种方法。除了肾移植之外，其他的两种肾脏替代治疗均不能完全替代肾脏的功能，因此透析治疗属于不完全肾脏替代治疗。选择透析治疗时还需要给予药物治疗，以控制和减少并发症，所以相对来说，肾移植是比较好的尿毒症替代治疗方法。
尿毒症是慢性肾脏病晚期，已经出现肾脏结构和功能的严重异常，肾脏已不能排出人体的毒素、代谢废物和多余的水分，只有依靠血液透析或腹膜透析以排除体内毒素等代谢废物。腹膜透析是用腹膜作为半透膜，利用重力作用将配好的透析液，经导管灌入腹腔而达到清除体内代谢产物，纠正电解质紊乱的目的。尿毒症不能完全治好，除非通过肾移植恢复肾脏功能，可以达到治好。
尿毒症期以代谢性酸中毒和水、电解质平衡紊乱最为常见，比如出现明显食欲不振、呕吐、虚弱无力、呼吸深长、皮下水肿、胸腔积液、高血压、酸中毒、高钾血症、贫血、谵妄、惊厥、幻觉、昏迷、精神异常等一系列表现。需要进行尿常规、肾功能、血生化等检查明确诊断，通常可见血肌酐异常升高，如果明确为尿毒症，应尽快住院通过血液透析等方式治疗。
尿毒症不能用药物治好。尿毒症又叫慢性肾功能衰竭，是肾脏已无法承担全身代谢，处于失代偿阶段的状况。肾单位一旦破坏是不可逆的，肾单位破坏后不可再生，因此药物治肾护肾只希望保护未破坏的肾单位，对已经破坏的肾单位无治疗作用。
