慢性肾盂肾炎的治疗分为普通治疗和抗感染治疗两部分，普通治疗包括多饮水，勤排尿；若伴有发烧，应对症降温处理，并卧床休息；若有结石或者畸形存在，可以进行外科治疗。抗感染治疗，针对培养细菌，进行相应抗感染治疗。治疗以后也需要每月复查1-2次，若有复发情况发生，则继续进行治疗，直到尿细菌培养为阴性为止。
得急性肾盂肾炎较好的治疗方法有：一般治疗，多饮水，勤排尿，以降低髓质渗透压，冲洗掉膀胱内的细胞，目的在于缓解症状，防止复发，减少肾实质的损害。手术治疗，手术治疗肥大的前列腺，使尿路梗阻得以解除，就可以有效的治疗慢性肾盂肾炎。
肾盂肾炎可分为急性肾盂肾炎和慢性肾盂肾炎。急性肾盂肾炎的治疗主要控制感染，慢性肾盂肾炎多数无明显临床症状，可定期监测尿常规及尿培养，药敏进行抗感染治疗。
出现慢性肾盂肾炎后的治疗办法有：病因治疗，先查明原因，再根据病因预防及治疗，若病情较轻，可按药敏选择用药，若病情较重，应用大剂量杀菌药治疗。紫外线疗法，对于反复发作的慢性肾盂肾炎无肾功能不全的病人，采用肾区紫外线照射，有一定的治疗作用。
患有急性肾盂肾炎的治疗方法是：抗生素治疗，应选用血中浓度高的抗菌药，若能同时使用尿中浓度高的抗菌药以保持尿中无菌，即能更好的控制急性肾盂肾炎的发展。祛除易惑因素，积极寻找并治疗诱发肾盂肾炎的因素，如解决尿路梗阻，治疗慢性病，纠正代谢紊乱等。
治疗慢性肾盂肾炎的方法有：手术治疗，手术治疗肥大的前列腺，使尿路梗阻得以解除，就可以有效的治疗慢性肾盂肾炎。紫外线疗法，对于反复发作的慢性肾盂肾炎无肾功能不全的病人，采用肾区紫外线照射，有一定的治疗作用。
