内分泌的检查分为物理检查以及化学检查，物理检查就是可以做垂体的核磁共振，甲状腺的彩超，甲状腺的静态核素扫描，肾上腺的CT。化学检查就是检查靶腺激素的功能。一般包括垂体的激素及其作用的靶腺激素，如促甲状腺激素以及甲状腺素，肾上腺皮质激素等。常规的项目包括促甲状腺激素，甲状腺激素和肾上腺皮质激素以及肾上腺激素皮质醇，醛固酮等，还有性激素六项。
内分泌检查包括功能的检查、定位检查和病因检查。在详细的病史、体格检查以后，通过化验激素以及内分泌试验检查来确定激素过多、缺乏还是激素存在抵抗。通过化验血和尿的标本进行免疫学的检查，发现激素水平是否升高。
内分泌检查主要是检查血液内性激素六项，在月经周期的第2-4天，在检查之前，禁止同房性生活，这时候查的结果，代表一个人的基础激素水平，通常空腹上午抽血为宜，抽血前静止半小时以上，避免激素水平因为运动而产生波动。然后对着用药较好注意卫生多运动。
做内分泌检查要在月经干净后的3—7天内，避开月经期，主要进行性激素六项检查，检查结果出来后找主治医师进行详细分析，针对性慢慢调理，调理期间饮食和作息都要严格按医生的要求做。
肛瘘的检查方法可以做肛门指检，肛门指检为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结。还有就是美兰造影，将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘。影像学检查包括B超、磁共振、肛瘘造影。手术探查需在麻醉状态下进行。
