长期服用羟基脲片的副作用主要是骨髓抑制，但为剂量限制性的毒性，导致白细胞和血小板减少，停药后，血细胞可自行恢复，还会有胃肠道反应，长期大量使用该药物，对肝脏、肾脏有损害，会有恶心，呕吐等不适症状，致睾丸萎缩和致畸胎的副作用，偶尔还会有中枢神经系统症状，脱发，药物性发热。
目前血小板增多症治疗的目的是治疗和预防血栓合并症。血小板计数应该控制在600乘以109以下，理想的数目是控制在400乘以109以下。临床上一线应用的降细胞药物是羟基脲片，治疗血小板增多症，8周内，大多数的患者血小板可降至500乘以109以下。
一般情况下，川崎病后血小板高指患有黏膜皮肤淋巴结综合征后血小板高，应遵医嘱使用药物进行治疗。如果患有黏膜皮肤淋巴结综合征，可能会出现高热、结膜红肿等症状，如果患有黏膜皮肤淋巴结综合征后血小板高，应遵医嘱使用双嘧达莫片、阿司匹林肠溶片、华法林钠片等药物，来抑制孩子血小板聚集，避免血小板较高引发孩子静脉栓塞。此外，患有黏膜皮肤淋巴结综合征后，如果除血小板高外，还伴有冠状动脉瘤等疾病，应及时在医生指导下进行高强度的抗凝治疗。
羟基脲属于处方药物，一定要规范用药，不坏处可能出现皮肤血管毒性反应（血管坏死和血管溃疡），如果长期服用羟基脲出现血管坏死或溃疡，一定要立即停用。需不需要继续吃，需要综合全身的情况和血常规的情况来处理的。
脾脏切除以后血小板多久可以降下来，是根据病情来决定的。如果对于正常的脾胀切除，比如由于外伤导致的，需要血小板需要很长时间，甚至包括一年到三年左右，才能够基本降到正常。
血小板高的时候血液粘稠度高很容易形成血栓而导致血管的堵塞，多喝水，稀释血液，注意观察有无不适的情况出现，可以服用一些抗凝药物避免形成血栓。如果发生冠状动脉的堵塞，就可能会出现急性心肌梗塞是会危及生命的，所以需要及时进行治疗。
